激光碎石是对肾脏危害最小的手术方式。碎石包括体外碎石和体内碎石，激光的穿透度有限，在碎石过程中，除了对局部非常近的组织有热辐射以外，没有其它的损伤，碎石比较安全。
可能会造成肾实质的损伤，导致肾包膜下血肿的出现。
老百姓常说的激光碎石，应该是体外冲击波碎石。体外冲击波碎石对于肾结石的治疗还是有很大的帮助，患者也更加容易接受。但是体外冲击波碎石如果操作不当，也会造成一定的危害的。首先结石的大小，最好在两公分以内。因为结石越大，碎石的难度就会增大；而且击碎的碎石不够小，在排石的过程中也会梗阻输尿管，引起肾积水及肾绞痛；而且结石越大碎石就越多，排石的时间就越长，可能也会造成结石残留。碎石过程中，如果定位不准确，可能会造成肾实质的损伤，导致肾包膜下血肿的出现。另外，体外冲击波碎石次数越多，发生肾脏萎缩的可能性就会越大。
建议患病后患者要多喝水，利于把肾结石通过尿道排出的，可以辅助治疗，但是要少喝含矿物质多的硬水，茶水也要少喝，正常的饮水就可以，每天喝的水也要适量，不宜过多，患者还可以多做跳跃运动，都可以帮助患者治疗疾病的。
会，震波碎石是指体外冲击波碎石术，是在体外利用超声波将结石震碎。由于结石与肾脏的密度不同，超声波遇到结石后就会释放能量将结石碎开。理论上体外冲击波碎石是精准碎石，对肾脏损害很小。但由于体外碎石机质量参差不齐，质量较差的碎石机做不到精准碎石，会对肾脏产生损害。
体外碎石的危害是可能导致永久性肾单位损失，并可导致一系列长期的不良反应，主要表现为肾实质损伤及包膜下血肿，肾盂破裂，肾单位永久性损失弥漫性纤维化瘢痕，完全性肾乳头坏死，甚至不可逆的急性肾功能衰竭。
微创碎石在正常操作下对肾脏伤害不大，如果操作不当则会对肾脏造成极大伤害。
微创碎石是我们通常所说的体外碎石或体外冲击波碎石，当肾结石较小且位置比较好对焦、定位的时候，精准击碎石头则对肾脏伤害很小；如果肾结石较多且位置容易偏移，则需要多次、大范围的进行治疗，则可能对肾脏造成比较大的伤害，甚至引起肾脏出血。
做微创碎肾结石的患者需要到正规医院泌尿内科或者肾内科找医生诊断后，再根据病情进行治疗；术后注意卧床休息、清淡饮食并增强营养、术后三天适当运动促进结石排出。
碎石对于肾也是存在有一定的创伤，但相对比手术创伤会小的很多，激光碎石只要方法运用得当，掌握得当，不会对肾造成多大的伤害，如果对于体积较大较复杂的结石，可能需要多次治疗后，肾会有一定的损伤。