跑步时肩膀疼可能是正常现象，也可能是炎症、心脏疾病等原因导致的。
在跑步时，部分人群肩膀可能会有疼痛感。主要是因为在跑步时，由于肺活量的增长，需要不断地进行深呼吸，这样会造成肩部肌肉的拉扯，从而造成肩部的疼痛。如果是心绞痛、心脏功能供血不足，那么跑步会增加心脏的负担，造成心肌缺血，甚至还会造成辐射性的疼痛。
多是由于跑步过程中头部容易向前倾，这就导致身体在疲劳不堪时，会不自觉的发生驼背的情形，当把身体向前倾时，脊椎就会向前弯曲，一旦头部位于身体的前面，就会给上背部施加压力和重量，从而就会出肩膀疼痛的现象。
跑步时肩膀疼主要是由于肩膀部位有拉伤或者劳损的情况，常见的是肩关节周围的肌肉、肌腱、韧带、肩袖出现拉伤或者劳损，比如搬抬重物时用力过大、持续进行肩关节的活动，导致局部软组织出现损伤，会形成炎性水肿。
跑步后出现背疼，可能由于缺少运动锻炼，或是由于跑步的运动量过大，产生背部的疼痛或酸胀感，跑步后应尽量做一些按摩，揉捏背部，帮助促进背部血液循环，起到缓解背痛的作用。
一般情况下，跑步时胸口疼的原因主要有以下几点：
第一，在跑步的时候，呼吸变深，会吸入大量的冷空气，这些冷空气会刺激气管壁和食管壁，从而导致膈肌痉挛、胃痉挛、胸口疼痛。第二，跑步还会导致心肌耗氧量增加，胸口疼痛也会导致心肌供血不足。第三，跑步的时候，双上肢前后摆动牵拉胸肌，胸肌的一部分附着在胸前胸骨肋软骨处，牵拉导致胸口疼痛。
胸肩膀疼可能是颈椎病、软组织挫伤或者扭伤、肱二头肌长头腱等，需要根据实际情况进行判断。
患者有胸部、肩膀酸痛的症状，首先想到的是颈椎病，尤其对于焦感神经型颈椎病的治疗，起病后极易引起颈肩背部疼痛，并有心慌现象、胸闷、胸部疼痛等症状。在手术过程中我们必须非常谨慎。再就是见胸肩部筋膜牵拉受损，此现象在扩胸运动中较为常见，由此造成胸肩部筋膜过度牵拉，因而造成伤害、水肿情况下，可造成显著胸部、肩膀部位疼痛的表现；再就是见于肩关节周围软组织挫伤或者扭伤，也会引发一定程度的肩周肌肉劳损的现象。再就是可见于肱二头肌的长头腱炎，此病例为狭窄性腱鞘炎，发病后可在肩前部表现出明显、胸有痛感，尤其当手臂向后伸时，会拉扯发炎的肱二头肌，因而造成了痛苦加剧。