如果扁桃体结石比较小，可以用镊子或刮齿就能够自行取出。如果结石比较大比较深就需要局部切开，然后让医生取出。如果反复发作比较顽固的情况下需要直接手术切除扁桃体。扁桃体结石一般位于扁桃体窝内。成年人扁桃体上凹凸不平有很多瘢痕，食物残渣以及细菌就会繁殖从而出现结石。会出现口腔内异味、疼痛等情况，饮食上要清淡，饭后漱口。
扁桃体结石一般清理价钱在几十元左右。
扁桃体并无结石存在，可能是慢性扁桃体炎引起的扁桃体隐窝口干酪样分泌物。扁桃体隐窝口的干酪样分泌物，呈乳白色或乳黄色颗粒样，气味臭，是由扁桃体隐窝内的大量脱落上皮细胞以及白细胞、淋巴细胞、细菌所组成。如无明显不适感，不需要特别进行清理，这些分泌物一般会自动排出、被咳出。如感觉到咽喉部有明显异物不适感，也可以到耳鼻咽喉科进行清理，费用无特殊的收费项目，各家医院相似收费，如咽部异物取出等。各省收费标准不同，如按咽部异物来收费，几十元左右。
扁桃体结石需使用手术处理治疗。需要到医院完善检查，明确病因病情，给予针对性治疗处理。生活中注意个人卫生清洁，合理饮食清淡，避免辛辣刺激食物，补充维生素微量元素等，在医师指导下选择好的手术治疗方案。
清理扁桃体结石的方法可以通过漱口，或者通过镊子将扁桃体结石夹出来。大的扁桃体结石，夹不出来，就需要到耳鼻咽喉科门诊去取出来。需要注意口腔卫生，饭后多注意漱口，可以进一步预防扁桃体结石的，扁桃体结石还会经常出现。
扁桃体结石主要是由于急慢性扁桃体的炎症反复发生导致的，隐窝口上皮的过度角化所形成的沙粒状的附着于扁桃体的表面。扁桃体结石一般不进行清理，因为扁桃体的结石附着的表面粘连非常紧密，而且相对很小，清理过后会造成的扁桃体表面黏膜的破损，会形成黏膜的疤痕，堵塞扁桃体隐窝分泌物的排泄。所以临床上不进行清理，可以用漱口水漱口。