病毒携带的状态，病毒与机体共处，互相无明显的影响，肝功能也没有明显的损害，生化指标基本正常就是乙肝疫苗耐受期。如果肝脏一旦进入免疫清除期，就是抗病毒的良好时机，这时候才可以抗病毒治疗。
乙肝存在一个慢性化过程，乙肝痊愈通常在急性感染期。
乙肝急性感染的时间不得超过半年，是急性感染期，这时阴转率可达60%-80%，因此应在这段时间内进行积极治疗。如果一个月后乙肝病毒还是（+），则提示可在短期内使用干扰素，有助于乙肝的完全阴转。
乙肝一旦感染半年以上，乙肝的根治难度更大，目前尚无彻底消除乙肝特效药物，建议积极配合医生治疗。
现在全世界都没有战胜过乙型肝炎，也没有能够根除乙型肝炎的新药，因此也无法根除。
乙型肝炎的治疗方法是保肝、护肝、抗病毒，因此，乙肝病人要进行肝功能检查，包括两对半、乙肝DNA和肝彩超，一旦有肝的异常，或是有明显的疲倦、厌油感、胃胀感等症状，应给予护肝、抗病毒的药物，一旦达到了抗菌指标，必须进行抗病毒，从而控制住了病毒的扩散，从而防止肝脏损伤和肝硬化。
针对乙肝的治疗，以前是没有专门的抗病毒药物，只有中药治疗，但效果不确切。后来一些专门针对乙肝病毒的药物开发出来，离彻底攻克乙肝还差一步。期待不久的将来，会有药物攻克乙肝的。
乙型肝炎免疫球蛋白是一种被动免疫，而乙肝疫苗是一种主动免疫，这是两种不同的类型，一种是母亲所生的孩子，如果是乙肝病毒的母亲所生的孩子，应在宝宝出生后24小时之内注射乙肝免疫球蛋白，并接种乙肝疫苗来防止乙肝的传染。
第二种是医护工作者或者其他工作岗位接触到乙型肝炎后，需要注射抗乙肝的免疫球蛋白，但在不能明确是否存在的情况下是否要注射免疫，没有的话要接种。
在乙肝治愈方面，目前还很困难，多数人都达不到治愈乙肝的目的。
少数人满足干扰素治疗指征，是可能达到乙肝表面抗原转阴和乙肝DNA转阴的，乙肝功能正常，即临床治愈之谓。由于这种病毒携带着人体免疫系统中一些免疫细胞，所以很容易引起各种病毒性肝病，包括甲型肝炎、乙型脑炎等。鉴于乙肝表面抗原的定量相对较少，病毒水平相对较低，肝脏在形态结构上无任何问题，肝功能轻微，中度异常者，这部分人可考虑干扰素抗病毒治疗，主动干扰素抗病毒治疗则，鉴于这一部分的确可能达到乙肝表面抗原转阴，乙肝病毒携带者或乙肝患者必须进行个体化治疗。