如果是由于先天性感染，会导致小于胎龄儿，小头畸形，肝脾肿大，皮肤瘀斑，脑积水，黄疸，脑组织钙化等多种症状，如果是在围生期感染，会出现咳嗽，发绀，气促，间质性肺炎，血小板减少性紫癜等症状。
巨细胞病毒性脑炎有亚急性或慢性病程，随后出现皮质功能障碍，从而引起意识障碍、昏睡、定向障碍以及癫痫发作等。如果伴有脑干损害时可出现局部症状。如果有坏死性脑干脑炎，可以发现该病与脑神经损害、眼球震颤有密切关系。
新生儿巨细胞病毒感染的症状主要有：
一、先天性感染。感染后的胎儿除了流产、死产外，约有5%的活婴，有典型的多系统多器官脏器受累。
二、围生期感染。主要是分娩时经过产道感染、经宫颈逆行感染、产后哺乳感染等。出生时没感染症状黄疸，主要有紫癜、早产、脑积水、肝脾肿大、小头畸形、体重过轻、脉络膜视网膜炎、脑积水、脑组织钙化、低钙惊厥、小儿畸形、皮肤瘀斑、脑组织钙化等情况。
气郁主要症状表现为烦躁易怒，胸胁胀满、女性乳房胀痛，小腹胀痛，月经不调等临床表现。出现气郁的，一般多由于情志不遂，或者是生活工作压力比较大造成的。治疗上主要是口服一些疏肝理气的药物进行治疗。平时保持一种乐观积极的生活态度，少生气。
偶发早搏可无症状，亦可有心悸或者心跳暂停感，还有一些有咽部紧缩感，持续时间比较短，每次持续1-2秒钟就可以缓解，缓解后完全正常。频发的过早搏动，可导致出现乏力、头晕等症状，原有心脏病者可因频发的早搏，加重心绞痛或者心力衰竭，出现心绞痛的加重或者躺不平，不能平卧。
有出生后不久出现昏睡、呼吸困难和惊厥等，并于数天或数周内死亡。其他症状有意识运动障碍、智力迟钝、肝脾肿大、耳聋和中枢神经系统症状等。只有少数在出生后3个月发生间歇性发热、肺炎和单核细胞增多症。