支原体感染本身可致不孕，流产早产，低出生体重儿和胎儿畸形。但是首先要看是怀孕几个月的时候感染的，如果是孕早期，对胎儿就可能有影响，孕中晚期胎儿的各器官已发育得较好时影响不大，孕期也是可以用药治疗的。
男性得了支原体感染可以通过药物进行治疗。
如果有支原体感染，可以通过口服莫西沙星、左氧氟沙星等氟喹诺酮类药物，以及大环内酯类抗生素。在服药的过程中要根据患者的病情进行适当的调整药物的用量，以达到改善病情的目的。男性要注意个人卫生；平时要多饮水，促进身体的新陈代谢，不要抽烟、喝酒。
男性支原体感染一般以呼吸道感染和泌尿道感染等为主，不同感染治疗方式不同。
1.呼吸道感染：肺炎支原体感染是导致呼吸道感染的原因之一，患者主要是应用抗菌药治疗，可适当给予小剂量镇咳剂和祛痰药。
2.泌尿道感染：患者应进行抗感染治疗，治疗药物主要包括大环内酯类、四环素类等抗菌药，具体用药谨遵医嘱。
一般情况下，小孩总是支原体感染，家长可以通过使用药物、补充营养等方式进行处理。具体内容如下：
1.使用药物：如果小孩支原体感染没有治疗彻底，可能会出现感染情况反复的问题，家长可以遵医嘱给小孩使用阿奇霉素片、注射用头孢曲松钠、阿莫西林分散片等药物进行治疗。
2.补充营养：如果小孩营养不良，可能导致身体虚弱，从而出现总是支原体感染的情况，家长可以多给小孩补充营养，均衡饮食，提高免疫力。
肺炎引起的支原体感染首先注意休息，放松心情。饮食宜清淡，多喝白开水，忌食辛辣刺激性食物。支原体肺炎的一个主要特征是肺内有少量的阳性体征和清晰的影像学特征。病灶边缘模糊，密度低，由肺门向外周肺野辐射，在肺实变受累时亦可见大片实变影。与一般细菌性肺炎所见下肺只有一处实变影或片状浸润相比较，支原体肺炎侵犯上肺者或双肺者多，但其吸收缓慢。
支原体肺炎也称原发性非典型肺炎、冷凝集阳性肺炎等，对于“非典型肺炎”之一，属支原体感染、表现为间质性肺炎和毛细支气管炎样变化。临床表现以咳嗽、咳痰为主，少数病例伴有发热等症状，病程较长，易反复发作。在儿童社区获得性肺炎中占10%%~40%，肺部病变表现为融合性支气管肺炎、间质性肺炎合并支气管炎，肺泡内可见少量炎症渗出物，并且会出现灶性肺不张、肺实变与肺气肿。
