主要使用药物治疗。分为国产和进口两种，国产每周打两针，进口每周打一针。使用药物一般在一年到一年半不等，根据病人病情而确定打的时间长久。使用治疗，可以使乙型肝炎小三阳转阴的几率非常大。但使用的唯一缺点就是副作用非常大，有很多不良反应。
肝小三阳病人，需要定期检测肝功能和病毒量的情况，如果肝功能有变化，就需要应用改善肝功能的药物，如果病毒载量高，就需要用药物。如果两项均正常，就无需治疗，需要保持身心愉悦，劳逸结合。
乙肝小三阳是指乙肝表面抗原阳性，乙肝e抗体阳性，乙肝核心抗体阳性，肝功能正常，病毒复制较少，可不必治疗，乙肝大三阳乙肝病毒在体内活跃的复制，具有了很强的传染性的，对肝细胞的损伤特别大，不吃油腻，戒烟酒，休息好保持心情舒畅，养成良好的生活习惯，饮食习惯，卫生习惯。
通常所说的乙型肝炎，指的就是乙肝病毒感染以后引起的肝细胞炎症性疾病。而小三阳，是乙肝病毒感染后的一种感染状态。有乙肝病毒感染，并不一定就是乙型肝炎。两者并不完全相同。乙肝小三阳，如果肝功能正常，就说明并没有明显的肝炎，只是乙肝病毒携带状态。
不可以喂养母乳。在怀孕期间一定要做完全套检查化验来衡量，然后怀孕后期一定要做阻断治疗，孩子出生的时候也要做阻断注射免疫球蛋白，然后接种乙肝疫苗以后才可以母乳喂养，不然感染给孩子的几率是非常大的。
小三阳未必就有乙肝病毒的，乙肝病毒DNA也可以阴性。乙肝病毒DNA检测小于下限就是说他检测不到，此时的传染性是非常低甚至是没有传染性的，如果小三阳且肝功能正常，乙肝病毒DNA长期稳定在检测不到的状态。