治疗的方法有循环衰竭的治疗法基本同感染性休克的治疗。主要有扩充有效血容量，纠正酸中毒，强心治疗。还有局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并且刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。
治疗的方法有病原治疗法通常需联用两种不同类型的抗菌药物，足剂量、长疗程。对于肠道黏膜病变经久不愈者，可采用保留灌肠疗法，还有对症治疗的方法，保持水、电解质和酸碱平衡，有失水者，无论有无脱水表现，均应口服补液。
治疗的方法有局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并且刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。还有循环衰竭的治疗法基本同感染性休克的治疗。主要有扩充有效血容量，纠正酸中毒，强心治疗。
应采取中医治疗，按中医分型辨证施治用汤药治疗，同时可加用针刺治疗以调整肠道功能紊乱。抗生素治疗，早期用适当的可吸收的抗菌药物治疗，可明显减轻症状和减少菌的排出。
细菌性痢疾是由于细菌导致的，所以应该选择敏感性的抗生素来治疗。可以经验性使用药物，同时进行药敏实验，及时调整药物治疗。同时应注意避免服用止泻的药物以免加重病情。可是适当给予盐水来改善失水的情况，保持水电解质的平衡。
支持和对症治疗，腹泻次数多者，大便会带走大量水分和电解质，导致脱水和电解质紊乱，轻者可予口服补液盐，严重脱水者，可考虑静脉输液。可以吃一些抗感染的药物，或者是治疗肠道炎症的药物，如果说是长期性的问题，就需要喝中药来调理。