对乙肝病毒有直接作用的，主要是抗病毒药物，在没有任何肝脏炎症和肝脏形态变化的乙肝病毒携带状态，并不建议口服抗病毒药物。其他的方法，大多都不直接针对乙肝病毒，而是针对肝脏的炎症，也就是保肝降酶以及抗肝纤维化。
有身体的不适，建议到正规医院的传染科就诊，检查肝功能，腹部B超，乙肝病毒DNA等明确病情。目前没有特效的药物和治疗方法，最有效的抗病毒治疗转阴率50%左右。如果肝功能异常则应考虑抗病毒治疗。
乙肝大三阳目前没有特效的药物和治疗方法。如果肝功能正常，可以暂时不用药，平时注意劳逸结合，饮食清淡均衡，不喝酒，定期复查动态了解肝脏变化情况。如果有肝功能的明显异常，就应该在医生的指导下服药，进行抗病毒、保肝治疗。
乙肝转阴的方法首先进行肝功能检查，只要肝功能正常，日常生活中注意增强体质，适当的做运动，平时不要过度劳累，多吃富含维生素C的水果，有猕猴桃、西红柿等，对肝脏有好处，病情可以逐渐恢复。若肝功能出现异常，增强营养，服用护肝的药物，促进肝功能的修复。
治疗乙肝的关键是清除病毒，大部分患者有免疫耐受力，一般药物难以根治，采用正确的治疗方法，才是乙肝快速康复的关键。目前治疗乙肝多选择中西医联合治疗，中医清热解毒，疏肝理气，健脾固肾，同时配合西医提高免疫进行治疗。
乙肝的治疗主要是通过抗病毒，包干等治疗控制病毒复制和恢复肝功能，改善临床症状，提高体质，增强抗病能力，促进免疫系统清除病毒，促进疾病恢复。乙型肝炎病毒复制明显的病人用抗病毒药物；有免疫功能紊乱的用调整免疫功能的药物；有肝细胞损伤的用保护肝细胞的药物；有肝脏微循环障碍的用活跃微循环的药物。