真菌感染是指免疫功能下降的人，由于免疫力下降，平时没有感染性的真菌就会侵入人体引起感染，出现发热等症状，细菌感染是常见的细菌有大肠杆菌，肺炎克雷伯杆菌，绿脓杆菌等，是最常见的院内感染类型。
皮肤细菌感染一般的消炎药物就有治疗作用，但是真菌感染主要是因为使用的消炎药物过多，导致一般的细菌被杀死以后才导致真菌感染，因为一般的消炎药物对真菌无效，只有专用的抗真菌药物才能治疗真菌感染。这就是区别。细菌感染是致病菌或条件致病菌侵入血液循环中生长繁殖，产生毒素和其他代谢产物所引起的急性全身性感染。
龟头细菌感染是龟头炎，如果是真菌感染就是会出现癣。细菌感染通常以化脓、渗出为主，而真菌感染，以龟头潮红、搔痒、分泌物多，清洗时包皮垢明显增多为主。细菌性龟头炎，通常消毒后，涂软膏。而真菌感染性龟头炎，消毒后，涂抗真菌软膏进行治疗。
真菌感染和细菌感染，主要的区别是真菌感染容易造成局部一些水泡或者脱皮的症状，而且相对比较顽固，要做一下相关检查，目前也可以适当外用一些消炎抗菌去痘的药物。细菌感染比真菌感染更常见一些。
龟头炎真菌感染局限于皮肤角质层的最外层，极少甚至完全没有组织反应，感染毛发时也只累及毛发表面，很少损伤毛发。龟头炎细菌感染当机体免疫功能下降时，不能充分发挥其吞噬杀灭细菌的作用，即使入侵的细菌量较少，致病力不强也能引起感染。
龟头真菌感染表现为包皮内侧及龟头弥漫性潮红，附着乳白色分泌物或分布许多针帽大小的红色小丘疹，自觉瘙痒比较严重。而细菌感染通常以化脓、渗出为主，而真菌感染，以龟头潮红、瘙痒、分泌物多，清洗时包皮垢明显增多为主。
