自身免疫性脑炎后遗症是癫痫发作：急性期癫痫发作者使用免疫抑制剂、免疫调节剂治疗后效果明显，认知记忆功能障碍：辅助进行神经康复，包括作业治疗、认知康复训练，有助于恢复。
免疫性脑炎的后遗症主要为癫痫发作、精神发作及记忆力障碍等。癫痫发作病人需服用抗癫痫的药物。精神发作表现为精神异常、行为异常、胡言乱语、沟通障碍、无法正常工作与学习。
自身免疫性脑炎是一组病因不明的难治性、局灶性持续发作疾病，并有进行性偏瘫及智力低下。病理上表现为一侧慢性脑炎。神经影像学上有进行性大脑半侧萎缩。自身免疫性脑炎的症状是以持续性局灶性癫痫发作起病，有局部定位征以及相应异常脑电波和影像学改变者，可诊断本病。但应排除常见病毒性脑炎伴继发性癫痫。
自身免疫性脑炎是一组病因不明的难治性、局灶性持续发作疾病，并有进行性偏瘫及智力低下。病理上表现为一侧慢性脑炎。神经影像学上有进行性大脑半侧萎缩。自身免疫性脑炎的症状是以持续性局灶性癫痫发作起病，有局部定位症以及相应异常脑电波和影像学改变者，可诊断本病。但应排除常见病毒性脑炎伴继发性癫痫，这个根据病情严重程度来决定。病情严重者可能遗留癫痫及认知功能障碍等。
脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
