深蹲后出现膝盖疼痛的原因，可能是膝关节出现退行性病变：深蹲时髌骨在股骨髁间运行，可能导致软骨磨损、退变，甚至出现软骨剥脱，膝关节疼痛；还可能是半月板后角损伤：在深蹲的过程中，内侧和外侧的半月板都会出现磨损，当损伤累积到一定程度时，膝关节会出现疼痛，尤其是深蹲的，时候，疼痛通常会加重。一般需及时就医明确具体病因。
深蹲导致膝盖疼痛，说明有两种可能，第一种你使用的重量太大了，膝盖负荷不了。第二种你姿势是不正确的，可以在短期之内尽量避免再次深蹲，微波理疗，可以使用活血化瘀药物治疗。
该有可能是膝关节的韧带，或者半月板拉伤，三墩的时候，牵拉引起的疼痛，主要考虑是剧烈运动或者外伤引起。到医院做一个膝关节磁共振检查明确诊断，先不要活动太多。根据检查结果进行相关治疗。
深蹲时出现膝盖疼痛等症状，一般是可以恢复的。患者首先应该避免深蹲，因为深蹲的时候，患者可能会因为上半身的重量负重而导致膝盖疼痛。所以只要尽量避免膝盖负重，减少膝关节活动度，一般都能缓解膝盖疼痛。另外还可以通过热敷来缓解膝关节疼痛。若是疼痛较为明显，建议患者及时就医，明确具体病因，对症进行治疗，防止病情延误。
深蹲后膝盖疼应该通过日常调理、其他治疗等方式来恢复。
深蹲后膝关节疼痛患者可以立即休息，减少膝关节的承重，避免重复做下楼梯或重复做蹲坐运动，早睡早起，不熬夜不赖床；还可以通过局部热敷、微波治疗、远红外线治疗、中药离子透入治疗等，或是服用抗炎药，比如塞来昔布、洛索洛芬钠等，使用敷通筋活络类膏药，或是氟比洛芬酯凝胶。
做深蹲膝盖疼可能是半月板后角损伤、骨关节炎等疾病导致的，具体分析如下：
1.半月板后角损伤：如果存在半夜班后角损伤，患者一般关节无明显红肿，在平时走路时无明显症状，但是在膝关节过屈，也就是深蹲的时候出现疼痛较重，导致做深蹲膝盖疼。
2.骨关节炎：随着年龄的增长，膝关节会发生退行性病变，软骨有一定程度的磨损剥脱、关节面不平整等，部分患者会出现骨关节炎，通常患者在上下楼、运动后、深蹲动作时出现膝关节的疼痛、肿胀、关节积液，因此做深蹲膝盖疼可能是骨关节炎导致的。