长期月经不调后果相当严重，有可能造成女性不育。
由于女性月经是靠定期排卵来决定的，若月经周期不准，排卵会出现异常，并且身体内激素水平会出现失调，因此在初期发现出现月经不调现象应积极进行治疗和调理，可到医院进行性激素六项检查，然后再遵医嘱服药治疗。
生活中还要养成良好的生活习惯，调节自己内分泌水平、早睡早起等，不能熬夜。
如果月经不调程度比较重的，后果较为严重，有可能会引起不孕。因为女性的月经取决于体内定期排卵的时间，排卵后14天才有下一次月经。若整个周期卵泡发育较晚，排出较晚，则月经推迟，因此月经推迟或不规律常提示为排卵不良或排卵延迟，这种情况下容易导致不孕不育。若有排卵不良，可能是子宫内膜缺乏保护。
许多妇女都会出现子宫内膜增生增厚、息肉甚至恶变，因此更严重的后果是对身体的创伤，如果出现子宫内膜增生，就会导致异常子宫出血。假如发生癌变，严重的会危及生命。
长期月经不调仍需尽快调整，将来可能会影响正常生育，注意安全等。建议积极调节身体和睡眠时间。高血压或贫血、休息不好都会影响月经，多吃些温热滋补的食物。但注意内裤要暴晒，注意补血和调节月经。
可以做人工周期调理月经，或是口服短效避孕药调理月经。如果只是因为精神压力因素，或者体内内分泌失调，或者只是子宫受凉引起的月经不调，吃一些对症的中药是可以有很好的效果的。
月经不调常如不及时治疗，很可能引发女性长期头疼。据统计，由于月经引发的头疼症状占女性整体头疼病症的20％，这也是女性头疼发病几率远远高于男性的主要原因。对于月经不调很多人以为是小兵，根本不引起重视，其实月经不调如果长时间不治疗会引起很多其它的疾病。
长期月季不调对身体的危害很大，月经不调容易导致病患出现月经性关节炎、子宫内膜移位、宫颈炎、月经性牙痛、月经性哮喘等病症，月经不调对女性造成的影响会给女性的身体健康带来了严重的威胁。