一般来说，对于右侧卵巢囊肿直径小于5cm，且患者没有任何不舒服的表现，对于这种情况可以考虑月经干净之后复查妇科彩超。对于右侧卵巢囊肿直径大于5cm，且复查妇科彩超持续存在，或患者合并有急性的下腹痛等，则建议患者前往医院就诊，在医生的指导下通过患侧附件切除术，患侧卵巢囊肿剥除术等方式进行治疗。
此外，患者应该注意局部卫生，同时注意适当运动，有助于改善症状。
卵巢囊肿有些偏大，达到了手术的指征还是手术治疗比较好。术后一个月内不要有性生活，平时要多注意局部的卫生，要以纯棉，透气好，宽松的内裤为主。也不要吃辛辣，刺激性，生冷的食物。
孕检发现，需要观察到孕12周，看囊肿大小有无变化。怀孕之后可以合并黄体囊肿，而黄体囊肿会随着妊娠周数的增大自行缩小甚至消失。孕12周可以根据囊肿的大小、性质、部位、孕妈及家属的意见来决定。对于直径大于8厘米的囊肿，在孕16-20周，采用手术治疗。
女性附件区囊肿很常见，分生理性的和病理性的。有腹痛症状的，应该是病理性的，在医生指导下可先药物保守治疗，每三天复查，如果在慢慢变小，症状在减轻直到消失，那么继续；如果还是这么大，症状不消失，那可考虑手术治疗。
囊肿直径小于5厘米，且无检查结果提示肿瘤则多为功能性囊肿，可2-3个月检查一次，没有不良性征，不予处理。若囊肿继续增大尤其大于5厘米者或者突然下腹部阵发性绞痛可能是肿瘤性囊肿或发生了囊肿扭转或破裂则应手术并确定其良恶性。
一般情况下，如果早孕期发现右侧卵巢囊肿，需要根据孕妇的具体情况来选择治疗方案。
在早孕期发现右侧卵巢囊肿后，如果卵巢囊肿不再持续的增大，也没有其他任何的异常症状，可以每两个月去医院做子宫和卵巢的B超检查，观察胎儿生长情况以及卵巢囊肿的生长情况，如果不再持续增大，先不用进行处理，将胎儿顺利生下后再进行治疗；如果卵巢囊肿持续增大，建议终止妊娠，然后再通过药物、手术等方式进行治疗，以免给身体造成不可逆的伤害。
