卵圆孔未闭一般不需要治疗。
不过绝大多数的病人都不需要治疗，只有一小部分需要治疗，因为卵孔发生了矛盾性栓塞，必须进行封堵。卵圆孔打开后，右心房的血液会从卵圆孔进入左心房，血液中的血栓和大分子物质会从卵圆孔进入血管，而血栓则会从卵圆孔进入大脑。血栓进入大脑后，会出现偏头痛的症状，而比较大的血栓则会引起脑梗。除了头臂的主干动脉外，它还可以通过动脉系统传播到身体的各个部位。许多病人出现了血栓，造成了心梗，也有可能是脾梗塞、肾梗死。因此，对于卵圆孔未闭的病人，应尽早进行卵圆孔封堵手术。
一般情况下，卵圆孔未闭的治疗方式需要根据患者的病情进行选择，具体内容如下：
如果患者出现了卵圆孔未闭的情况，患者应及时到医院就诊，以明确自身的情况。如果患者的症状比较轻微，右向左的血液分流量较小，患者通常可以遵医嘱进行抗栓治疗，以改善不适症状。但是，如果患者卵圆孔未闭的情况比较严重，出现了比较大的分流量，患者则需要接受经皮卵圆孔未闭封堵术，以改善卵圆孔未闭的情况，促进患者身体恢复健康。
封堵卵圆孔未闭介入治疗主要效果是减少不明脑卒中及脑卒中的复发。卵圆孔是心脏房室间隔在胚胎时期的一个生理性通道，正常在出生后5个月-7个月左右融合，若未能融合则形成卵圆孔未闭，卵圆孔未闭与不明脑卒中之间存在着密切的联系。总的卵圆孔未闭的介入治疗技术已经非常成熟了，对于卵圆孔未闭的治疗成功率基本上已经达到了100％。因此可以说治疗效果良好。
婴幼儿心脏卵圆孔未闭坑可能不需要治疗，也可以选择手术进行治疗。随着呼吸开始以及出生后血循环压力改变，大多数的卵圆孔可以发生闭合，只有少部分遗留有卵圆孔未闭。如果不是很严重，一般不需要特殊治疗，在一岁左右就能自动闭合。但如果婴幼儿心脏卵圆孔未闭坑，需要采用手术的方法进行治疗，从而达到卵圆孔闭合的目的。
如果新生儿在三年内还未闭合，是需要做手术的。卵圆孔在出生后第一年闭合，若出生后三年未闭合者，称卵圆孔未闭，会导致循环和呼吸障碍，是一种心脏畸形。是需要通过手术进行治疗。
不需要手术治疗。卵圆孔是胎儿时期正常的生理通道，人出生以后会开始有呼吸的功能肺血管阻力逐渐降低，而且其静脉封闭了。从下腔静脉注入右心房的血液减少，从而压迫卵圆孔瓣膜紧贴第二房间隔使卵圆孔关闭。