肛周脓肿早期可以用抗生素来控制进一步发展，但是如果已经形成脓肿了那就不是吃药的问题了，那就需要手术治疗了。可以做肛门镜检查，以明确具体诊断，方便进一步治疗。
肛周脓肿就是肛门周围软组织感染化脓，形成脓肿，如果是早期感染，脓肿还没有形成，可以用抗生素消炎抗感染治疗，是可以好转恢复的，肛周脓肿是由于细菌感染所致的软组织急性化脓性疾病，是肛肠外科比较常见的急症，多为需氧菌，厌氧菌和多菌种混合感染。
绝经后肛周脓肿可以通过手术的方式治疗效果是比较快的。肛周脓肿可以先抗炎治疗，严重的需要手术治疗，术后也要继续抗炎治疗。肛周脓肿需要抗炎的同时手术切开，术后继续抗炎治疗，每天伤口消毒，不要沾水，以免感染。
肛肠常规检查看：看红肿范围，看齿线处有无黏液流出，籍此来判断内口位置。看是低位还是高位，平时注意饮食如多喝水，多吃水果蔬菜，少吃辛辣。排便时间不宜过长，平时不宜久蹲久站久坐，排便后有温水清洗肛门。
肛周脓肿自行破溃后需要及时去肛肠科进行处理，需要及时进行手术引流，争取把脓液排干净，这样愈合的快，也可以防止肛瘘的产生。手术后必须保持大便通畅，多吃水果蔬菜喝香油，避免大便用力，坐浴，每天三次，每次十分钟。
如果肛周脓肿得到及时有效的对症治疗。可能不会形成肛瘘的。如果引流不彻底。有可能形成肛瘘。这需要两三个月，具体时间没办法确定的。建议手术治疗后注意调养。按时作息，多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，忌食辛辣等刺激性食物，保持大便通畅。