肛周脓肿自行破溃后需要及时去肛肠科进行处理，需要及时进行手术引流，争取把脓液排干净，这样愈合的快，也可以防止肛瘘的产生。手术后必须保持大便通畅，多吃水果蔬菜喝香油，避免大便用力，坐浴，每天三次，每次十分钟。
肛周脓肿自己破了，现在已经没有脓水和血水了，考虑是不要再手术的，脓肿做手术的目地主要也是引流的，就是要把脓液引流出来，只要引流干净了，不要手术的，可以继续坐浴消炎。
小孩肛周脓肿建议及时就诊，通过抗感染进行治疗。
小孩的肛周脓肿如果发病时间比较短，还没有形成明确的脓腔，这种情况下一定要积极的就诊，通过抗感染治疗，因为小孩一般不使用药物治疗，所以建议静脉输注抗生素，或肛周脓肿表面涂抹抗生素。如果小孩的肛周脓肿已经明确形成脓腔，建议积极的手术治疗。一般可以做肛周脓肿切开引流术。
肛周脓肿自行溃破如果脓肿小可以适当的按压周围的脓肿，帮助脓肿排除，脓肿较大波动感明显的情况下，还是需要做手术引流，要选择抗生素控制感染，注意清洁卫生，少食刺激性食物。
肛周脓肿是因直肠炎症等蔓延到周围形成是一个浓腔，脓液较少时可以通过大剂量的消炎药治疗，但脓液较多时应该要切开引流，并且要大剂量，长时间用消炎药治疗（一般7-10天）。肛周脓肿如果不及时处理，浓腔破溃后就发展形成肛瘘，肛瘘治疗就相对复杂了，所以建议在医生的指导下消炎治疗，如果浓液太多没法控制，要尽快切开引流。