肾结石的症状和其大小、存在时间、是否伴有积水等有直接关系。多数的小的肾结石是没有任何症状的，多数患者是在体检时才被发现，如果小结石落入了输尿管则会刺激输尿管壁而引起输尿管痉挛，从而出现肾绞痛、血尿症状，部分患者还会伴有恶心、呕吐症状。
肾结石最常见的症状是剧烈的腰痛以及肉眼血尿。如果伴有尿路感染，尤其是急性肾盂肾炎的病人，还会有发热、寒战以及尿频，尿急、尿痛等症状。有些肾结石从输尿管排到膀胱里，肾绞痛可能暂时能够缓解，但是有尿流中断的现象，主要是结石堵塞尿道内口引起的。肾结石比较常见的症状，如果要确诊，临床上一般借助于泌尿系的超声或者腹部平片来检查。
肾结石的患者大多没有症状除非肾结石从肾脏掉落到输尿管造成输尿管的尿液阻塞常见的症状有腰痛、盗汗、痛到目癣恶心、呕吐、烦躁不安、腹部闷痛、血尿等如果合并尿路感染也可能出现畏寒、发烧等现象。
肾结石的症状与结石是否活动有关，如果肾结石在肾盂里固定不定时，一般没有任何不适症状；肾结石在肾脏里活动，或者顺着尿液往外排，且卡在输尿管的某处，此时可出现剧烈的肾绞痛，可以向大腿内侧放射，并伴有尿频、尿急的症状，甚至出现一过性肉眼血尿，还可能出现全身大汗、恶心呕吐等迷走神经兴奋的症状。
肾结石症状可能是排尿痛，主要发生在腰、上腹部、肋骨的边缘与脊柱的交界处。
肾结石卡顿后会出现持续的疼痛，同时还会出现腰酸胀的症状，运动或者是工作都会导致疼痛加重。病情严重者可出现脸色苍白，出汗，血压低，甚至出现休克。出现恶心、呕吐、腹胀、便秘等症状。临床上比较常见的是血尿，尿液中有红细胞。主要表现为尿路感染、积水、腹部胀痛、尿频、尿急、尿痛、尿液中有少量的细小颗粒等。