治疗小三阳一般是要通过口服抗病毒的药物，一般可以达到完全清除的目的。同时还要注意饮食，以免加重肝脏的负担，减少肝脏的抵抗力，同时还要多吃维生素含量比较高的食品，提高人体的免疫力。
小三阳首先应检测肝功能，化验血中HBV-DNA含量及前C基因变异情况，并通过必要的肝活检来正确分析这种“小三阳”是否需要采取治疗措施。一般而言，如果肝功能正常，HBV-DNA阴性，不需要治疗，半年定期复查。如果肝功能异常，HBV-DNA阳性，则需要治疗。
乙肝小三阳表明它感染了乙肝病毒。然而，与大三阳相比，现阶段病毒的感染相对较弱，但仍有一定的感染。通常，它可以一起吃，即使握手和拥抱也不会传染，但不能过于亲密接触。乙型肝炎是一种不治之症，只能在临床上缓解。
乙肝小三阳喝茶方面可以适当的喝一些白茶或者是绿茶也可以喝一些枸杞，菊花，决明子，茶这个可以起到保肝护肝的作用的，乙肝是由于感染乙型肝炎病毒引起的，慢性传染性疾病。
乙肝病毒病人有大三阳小三阳，以及单纯表面抗原阳性等多种存在形式，需要结合肝功症状，病毒数量多少，确定是否用药治疗小三阳病人，如果肝功正常，病毒数量不多，是不需要用药治疗的，定期复查就可以，平时不要饮酒，不使用对肝脏有损害的药物。