避免精子畸形要注意养生，减少感染，慎用补品，调整起居。要改掉不良的生活习惯，如生活不规律、饮食嗜辣、久坐等。因此，男性应注意不嗜酒、辣，还要不穿或少穿牛仔裤，不洗或少洗桑拿浴，避免高温和辐射的工作环境等。要适当运动，注意饮食清淡。
引起畸形精子的原因有很多，因此畸形精子症的治疗要消除不利因素（药物、放射线、高温、酒等），针对病因进行治疗。由生殖道感染引起畸形精子症的，可进行抗炎治疗；由内分泌异常所致畸形精子症，则给予内分泌功能调整；对精索静脉曲张引起畸形精子症的，应考虑手术治疗。畸形精子如超过70%，应进行染色体检查，如有染色体病，则治疗困难。喝点中药或者是吃点中成药，调理，都是可以的。锻炼身体，劳逸结合，避免烟酒刺激。
睾丸是产生精子的场所，大量畸形精子表示睾丸有异常。常见原因有服用某些药物、精索静脉曲张、生殖系感染等。酒精、烟草、慢性中毒等也是引起精子畸形的重要原因。建议到正规医院男科，通过男科检查、精液分析、前列腺液及衣原体支原体检查、免疫学检查、精浆生化检查、阴囊彩超等查找致畸原因，针对病因制定治疗方案。
精子畸形可以选择中医治疗，多属肾精不足引起的，平时注意休息，加强锻炼，口服中药调理，用药期间禁止性生活，忌食辛辣刺激，油腻的食物。可以到正规诊所检查，好对症下药。
如果是男性不想进行长时间的调整，可以用一些裴尔科密度梯度离心法，对精液中的精子进行分离，通过这种方法可以找到形态正常的精子，再进行人工授精，这也是一个办法。从根本上治疗，男性出现精子畸形，一定要了解发病的病因，准确的消除病因，这是最直接的办法。