如果是男性不想进行长时间的调整，可以用一些裴尔科密度梯度离心法，对精液中的精子进行分离，通过这种方法可以找到形态正常的精子，再进行人工授精，这也是一个办法。从根本上治疗，男性出现精子畸形，一定要了解发病的病因，准确的消除病因，这是最直接的办法。
精曲造成的精子畸形可通过先进的显微外科精索静脉曲张高位结扎术治疗，通过手术可阻断损精物质反流，同时降低睾丸温度和静脉压从而改善精液品质，提高自然受孕率。因吸烟、酗酒或生活工作环境所致的精子畸形，应注意调整生活习惯，积极运动，戒烟戒酒，保持良好的卫生习惯，远离存在健康隐患的工作环境。
治疗男性的精子的畸形可以通过服用药物来调理治疗。平时生活中应该多吃富含锌硒的食物对改善精子畸形，及时补充蛋白锌硒有助于降低精子畸形率，增加精子数量，提高精子质量和免疫，提高男性生育能力。另外，要戒烟酒，忌食辛辣刺激性食物。
精子畸形是指精液中畸形精子超过50%，精子头、体、尾的形态变异。有精子畸形的大部分人都是从事高压的工作，或者是由于工作过度紧张，从而引起精神压力大所导致。所以在日常工作中，避免压力过大，要尽量的放松。注意多休息，忌辛辣饮食，不要抽烟饮酒。
应去正规医院检查，配合医生治疗，精子畸形跟男性的体质、营养缺失、环境污染等有一定的关系，是男性体内缺乏微量元素锌和蛋白质等所导致的，治疗上除了要远离环境污染，主要是补充锌和蛋白质为主，可以服用中药来进行调理一段时间，再做复查看看，平时要多参加一些体育活动，多吃一些含有钙，锌等微量元素比较丰富的食物。不要熬夜，多休息，少吃刺激性食物。