医学认为感染是疾病的主要原因。肛周脓肿可由肛裂、痔疮、肛窦炎、肛周皮肤滤泡性汗腺炎、肛周皮肤病等感染引起。某些疾病，如溃疡性结肠炎、再生障碍性贫血、全身营养不良，使身体虚弱，降低抵抗力，并诱发肛周脓肿。一般也会见到因为肛门直肠手术引起的感染，从而形成直肠周围脓肿。尿道术后感染、尾骶骨骨髓炎术后感染、产后会阴破裂缝合后感染等手术都可能引起脓肿。
肛门脓肿严重。因为发病比较急，疼痛比较厉害，短时间内可以沿着肛周的脂肪间隙蔓延。如果是慢性的肛周脓肿，一般形成脓肿会有一个过程，疼痛不是特别厉害，全身症状不是特别重。
肛门脓肿的症状。肛门脓肿属于肛周的一种急性感染，多继发于肛腺的炎症反复发作不愈，病人会有明显的肛门疼痛伴有发热，排便时也会导致症状的加重，深部的脓肿还会有明显的寒战和乏力，化验也会表现为血常规白细胞和中性粒细胞比例明显增高，查体在肛周表现为皮肤充血水肿的炎症表现，局部充进行穿刺可以获得脓液，早期诊断应该及时的选择手术切开引流。
肛门脓肿最主要的症状是疼痛，这种疼痛会非常剧烈，且逐渐加重，很多病人说会吃不下，睡不着。脓肿自行溃破后，疼痛暂时有所缓解。低位脓肿出现剧烈肛门疼痛，且这种疼痛持续不减。直肠周围脓肿（高位）就不一定会疼痛。因为直肠周围属于盆腔，这里分布的植物神经对普通刺激不敏感，最主要表现是局部坠胀和便意感。
肛周脓肿指是肠道菌进入肛窦致其发炎，堵塞肛腺开口，致肛腺液流出受阻，引起肛腺感染，再通过肌间隙淋延迟至肛周间隙形成脓肿。临床上最常见的症状就是疼痛，逐渐加重，并且局部红肿，皮温升高。按压可扪及包块。
