通常情况下，月经总是不干净，可能是内分泌紊乱导致的。具体分析如下：
精神紧张、过度劳累、环境改变、精神紧张等都会引起女性的内分泌失调，进而容易影响月经。出现上述症状可以到医院检查性荷尔蒙六项。子宫内膜息肉、子宫肌瘤、子宫内膜炎等都会引起女性的不洁。需要到正规的医院进行妇科检查。女性来例假时经常不洁，比如上节育环等。
流产不干净的症状需要分情况来看，如果是药物流产不干净，主要的症状是会有持续的阴道出血，出血量会比较多，同时会伴有腹部的阵发性疼痛。患者需要进行彩超检查，能够看到宫腔内有残留组织淤积。如果是人工流产不干净，主要表现为阴道出血，出血量可能较少，出血淋漓不尽，具有持续性。无论是药流不全还是人流不全，患者都应当及时就医，进行清宫手术，避免感染。
药流不干净后清宫是会疼痛的：
无论是人工流产的刮宫还是药流的清宫都是挺疼的，因为要用负压吸宫去吸子宫腔里的东西，但现在有无痛技术，当药流流不干净而做清宫时，也可以在静脉全麻下做清宫，这样能减少疼痛。
日常生活中，建议清宫后的女性注意保暖，不要吹冷风、碰凉水，并且注意保持外阴部清洁卫生，每天用温开水清洗1-2次以防止感染。
一般情况下，月经总是不干净流褐色分泌物，这种情况一般是属于经期延长。
可能是子宫内膜息肉、子宫腺肌病、子宫平滑肌瘤、子宫内膜恶变和不典型增生引起的，还可能是全身凝血相关疾病、排卵障碍、子宫内膜局部异常、医源性原因。另外，还有一些不常见的异常子宫异常出血，如动静脉畸形、子宫肌层肥大等。患者需要及时前往医院就诊，明确病因后对症治疗，以免延误病情的诊治。
妊娠物残留会表现为人流后一直出血，或者下腹疼痛不适，检查B超提示妊娠物残留。如果出现这种症状，则需要2周后进行尿hCG的测定，如果呈阴性，则可以排除妊娠物残留的可能。如果阳性，则需进一步评估。
会因长期淋漓不尽的出血，而导致宫内感染的危险。药流如果不彻底，可以引起腹痛，阴道流血，月经不调等症状，药流没流干净会导致再次怀孕，还得做第二次人流，对身体造成的伤害也很大，遗留在子宫内会造成感染、大出血、不孕等严重的后果，严重威胁生殖器健康。会导致宫内感染、盆腔炎、附件炎、输卵管炎合并堵塞、不孕不育等。建议在药流后10天左右，去医院，根据B超检查情况而决定处理方式，如果残留物比较小的话，可以不用清宫处理，给予口服生化颗粒。
