会因长期淋漓不尽的出血，而导致宫内感染的危险。药流如果不彻底，可以引起腹痛，阴道流血，月经不调等症状，药流没流干净会导致再次怀孕，还得做第二次人流，对身体造成的伤害也很大，遗留在子宫内会造成感染、大出血、不孕等严重的后果，严重威胁生殖器健康。会导致宫内感染、盆腔炎、附件炎、输卵管炎合并堵塞、不孕不育等。建议在药流后10天左右，去医院，根据B超检查情况而决定处理方式，如果残留物比较小的话，可以不用清宫处理，给予口服生化颗粒。
会对身体有很大程度的损伤，病症会反复的发作难以控制，不清宫的话，下体长期出血也会引起阴道等部分感染，这样会增加患者的生病概率，严重可导致不孕。药流不干净很容易引起众多感染的病症，阴道感染或者出现宫腔内感染，甚至会出现不孕不育的情况，会带来很多的妇科疾病，可能会导致宫腔感染，而且还可能会引起宫腔残留，还会影响正常排卵，内分泌不调，而且毕竟是死血，会有恶臭，细菌也会趁隙繁殖，感染到卵巢输卵管，就有可能会导致不孕。同时还可能会导致凝血障碍而引起大出血，严重的时候甚至会导致堵塞子宫，出现不孕不育的情况。手术后注意休息至少2周，避免剧烈运动，保持心情舒畅，情绪不宜过于激动，多喝水，不能吃凉的、辛辣刺激性食物，保持外阴部的清洁，每天可以用清水清洗，服用抗菌药物。
药流后是否需要清宫需要根据个人的情况来定。如果是服药后见到有孕囊排出，之后流血不多少于月经量也可以暂时观察不用清宫，但一周后，一定要去医院做一个超声检查，明确宫腔内是否有胎物残留。
药流不干净后清宫是会疼痛的：
无论是人工流产的刮宫还是药流的清宫都是挺疼的，因为要用负压吸宫去吸子宫腔里的东西，但现在有无痛技术，当药流流不干净而做清宫时，也可以在静脉全麻下做清宫，这样能减少疼痛。
日常生活中，建议清宫后的女性注意保暖，不要吹冷风、碰凉水，并且注意保持外阴部清洁卫生，每天用温开水清洗1-2次以防止感染。
如果确认是没流干净，就必须及时进行清宫手术，如果不清宫会得严重的妇科炎症，对以后生宝宝也是有很大影响。药流会有失败的风险，当药流不干净，就必须进行二次进行清宫，否则会导致宫内感染，盆腔炎，附件炎，输卵管炎合并堵塞，不孕不育等，甚至引起大出血危险生命。建议到正规医院做药流，休息1-2周，避免干重体力活和冷水作业，以免身体抵抗力降低而诱发其他疾病。同时还要加强营养，多吃高蛋白及补气血的食物，有利于术后身体的恢复。
还要在家休息14天左右，清宫术即刮宫，清宫术是早期人工流产最常采用的方法。清宫术虽然不用开刀，但也是一种妇科手术，一定要严密消毒的情况下进行。平时要注意个人卫生，禁盆浴及性生活一个月，清淡饮食及合理营养。