肾积水绝大多数都可以治疗好，特别是积水程度不重。如果积水程度很重，即使手术后肾脏积水只会部分缓解，不可能彻底恢复到与生病前一样的状况。肾积水治疗的主要目的避免肾功能损害，找到引起积水的原因，将引起积水的原因去掉，肾积水就会自然而然的缓解。
肾结核可以治疗好。肾结核可能是由身体其他部位的结核病并发症引起的。临床上，结核病仍然很常见。应该先查明身体其他部位是否存在结核病。在治疗方面，主要使用抗结核类药物。三到四种药物需要联合使用，随着年龄的增长，服药期间还需要遵循医生的建议检查肝功能，以免损害肝功能。
肾积水的治疗办法首先要明确肾积水的病因。如为憋尿过于明显引起的肾积水，建议可以通过勤排尿、多喝水、避免长期久坐，憋尿等习惯来改变。大多数不用治疗，可完全治好。而由泌尿系感染引起的肾盂积水，多建议应用抗生素治疗，建议行中段尿微生物培养、泌尿系彩超、泌尿系CT等相关检查，治疗疗程一般为2周，为复杂性尿路感染。
肾积水通常多在妊娠中晚期出现，遇此情况时，通常会通过孕检、B超进行检查，检查出此情况后，主要观察积水情况。
轻度肾积水的话，一般情况下，采取左侧卧位的方式就能够达到减轻的目的，当然一定要经常去医院进行定期的复查。要是积水渐渐的加重的话，必须清楚病因，在需要时，应置双接管引流同侧，以保护同侧肾功能继续受损。
肾切除术，肾积水严重，剩余的肾实质过少，或伴有严重感染即肾积脓时，如对侧肾功能良好，可切除病肾。病因治疗，去除肾积水病因，保留肾患，手术方法取决于病因的性质，例如先天性肾盂输尿管连接部狭窄可作肾盂成形术，肾输尿管结石可行碎石或取石术，这些手术近年可用内腔镜进行。
