脑核磁共振检查可以看到脑实质的结构，有无占位性病变，有无脑出血，脑梗死等，尤其是对脑髓质疾病、肿瘤、水肿等诊断的敏感度高。磁共振头颅检查主要用于脑血管疾病，如脑缺血、脑梗死、脑出血、血管畸形等。
一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
做头部磁共振的时候，跟磁共振检查都是一样的。首先就是自己做好准备，肚子不要太饿也不要太饱，大小便先排掉，这样就会比较轻松一些。另外就是身上的金属异物都要拿掉，尤其是发卡。
可以检查脑实质，侧脑室，中线结构，鞍区，双侧乳突，双侧眼球及眼眶，以及部分鼻窦和鼻咽。磁共振在临床上的应用非常广泛。磁共振检查头部，对于头部所存在的绝大部分问题都可以查出来，磁共振对软组织的检查更具优势。
ct对人体的辐射，自然是最大的。ct是利用X光X线进行CT检查，然后通过电脑进行综合比较，得到的结果。一般的ct检查，相当于几次或几十次的x光照射，因此，如无特别需要，不宜频繁的ct。而核磁共振仪则是将人体内的电磁波信号收集起来，然后用影像来显示。目前还没有相关的医学记录来证明电磁对人体的伤害。
头颅ct检查一般是根据病变部位的形态来确诊，而MRI则是根据病变的类型来进行鉴别和确诊。某些疾病在ct上没有明显的表现，但是在MRI检查中会发现。如患者是初期的脑初血，则有临床表现，但ct检查无显著病变，可以通过MRI可以确定病变的位置和出血的程度。因此，需要根据病人的具体情况来进行检查。建议患者及时去医院就诊，根据自身情况，选择合适的检查。
