一般情况下，先天性室间隔缺损手术是在全身麻醉下切开胸部，切开右心房缝合或修补缺损部位。或经大血管介入封堵缺损处。
通常在全身麻醉之后，先将皮下脂肪、肋骨和肋间的切口锯断，露出胸部，通过体外循环法引导血进入体外，随后冷却，减少氧气消耗，打开右心房，寻找缺陷，用补丁等材料将缺损修复，重新封闭，在完成复搏后，将血液回流，封闭胸部，将皮下脂肪缝好。麻醉和苏醒之后，便完成了该手术。
室间隔缺损患儿需要常规彩色多普勒超声复查。随着婴儿年龄的增长，逐渐痊愈是可能的。孩子还没有痊愈，就要进行这种修补手，这种修复手术非常有效。修复手术后，孩子的疾病可以完全治疗好。
这个是属于先天性的心脏病，当然对孩子存在一定的不良影响的，如果一直没有自愈的话，那就需要通过心脏手术进行修补的，可以考虑手术治疗，但是手术比较大，风险比较大，费用也比较高，可以到大医院心脏外科手术治疗。
室间隔缺损卵圆孔未闭在2岁后是要手术治疗的，先观察看，加强营养，避免受凉，定期到医院复查。很多室间隔缺损小的有的在10岁以前自行关闭，在生后第1年闭合，应定期复查心脏彩超即可。平时应该注意防止呼吸道感染。如能自行关闭较好，如不能自行关闭择期手术治疗。
室间隔缺损的手术方法：在气管插管全身麻醉下行正中胸骨切口，建立体外循环。阻断心脏循环后，切开右心室流出道前壁，虽可显露各类型室间隔缺损，但对心肌有一定损伤，影响右心功能和损伤右束支。目前多采用经右心房切开途径，这对膜部缺损显露更佳。高位缺损，则以经肺动脉途径为宜。对边缘有纤维组织的较小缺损可直接缝合，缺损小于lcm者则用涤纶织片缝补。
通常情况下，室间隔缺损3mm必须做手术。具体情况分析如下：
如果出现大于2mm的室间隔缺损，就会出现明显的左右分流，长期的分流会造成左右心室的扩张，同时还会影响到心脏的功能，甚至还会影响到动脉的血液中的氧气，从而对身体造成伤害。3mm的室间隔缺损，如果缺损部位比较好，可以考虑进行介入封堵治疗。缺损部位不理想，无法进行介入封堵，可以选择手术进行封堵。
