主要的副作用有恶心、呕吐、头痛、月经不规则等，而这些副作用事实上并不常见，而且停药后就会消失。紧急避孕药对月经的影响主要表现在月经周期的改变，可能提早或者延迟，尤其是多次重复使用者，会导致月经紊乱、出血淋漓不尽。
通常同房没有采取避孕措施，此后服用紧急避孕药，停药后的3天-7天有撤退性出血，没有出血可能是避孕失败，怀孕导致的。紧急避孕药有90%的概率成功避孕，但是有10%的概率避孕失败。若没有出血建议密切观察，月经推迟建议到医院检查人绒毛膜促性腺激素，若人绒毛膜促性腺激素升高，则是怀孕，表明避孕失败。可能是药物疗效不好或女性敏感性不好，服药超过72小时也是能的。
此处的出血一般是指阴道出血。如果吃的是紧急避孕药，那么一个星期后出现阴道流血的情况，这通常是撤退性出血导致的，表明避孕成功，是正常的生理现象，不必过于担心。在这种情况下，女性要注意外阴清洁，避免劳累、同房，平时注意观察即可，无需药物治疗。但是如果阴道流血量比较多，建议女性及时就医，并在医生指导下使用妇科止血灵进行调理。由于紧急避孕药含有大剂量的激素，所以在吃完紧急避孕药以后可能会导致月经紊乱，建议女性进行性生活时采取安全、可靠的避孕方法，尽量少用紧急避孕药。
一个星期吃两次避孕药可能会引起内分泌失调的情况，具体分析如下：
一个星期吃两次避孕药，容易导致内分泌失调，出现月经紊乱。该药的主要成分为孕激素，服用过量会出现不规则的阴道出血等症状，出血量过多会导致、大出血、失血性休克等症状，若持续少量的阴道出血，可导致失血性贫血的症状。因此需要谨慎使用这种药物。平时饮食上要注意清淡，不吃生冷、辛辣刺激的食物，保持局部卫生清洁。
不一定就会导致撤退性出血。没有撤退性出血，并不能够再代表避孕失败。现在自己注意多休息，过一段时间自己用早早孕测试一下，或者去医院抽血化验一下。
紧急避孕药一年内服用不应超过三次，每月一次。如果一周吃两次紧急避孕药，对身体是有害的。一个星期吃了两次紧急避孕药的危害，比如会导致月经紊乱，内分泌紊乱，还会有恶心、呕吐、子宫异常出血、经期改变等。
但一般来说，副作用会随着药物的代谢而逐渐消失。这期间要注意多吃新鲜水果、蔬菜，多喝水，促进身体新陈代谢。
