肾结核是全身结核病的一部分，治疗时应注意全身治疗。根据病人选择药物治疗和手术治疗两种方式。药物治疗的原则多采用早期、适量、联合、规律、全程的办法，药物治疗适用于早期的肾结核病人。比如尿中有结核杆菌，而影像学中没有肾盂、肾盏的变化，或者可以看见1-2个肾盏呈不规则的、虫蚀样的表现，这时正确使用抗结核药物的治疗是可以恢复的。
及时到正规医院就诊，系统的完善相关检查，一经确诊，尽早治疗，促使病灶愈合及防治并发症，主要是抗结核化学药物治疗及对症治疗为主。肾结核并发症包括化脓菌的重复感染，脓肿形成窦道和皮肤瘘管，广泛组织坏死可引起出血或顽固性疼痛，部分病例可出现高血压，晚期患者可导致无功能肾和肾结石等。结核菌经肾内淋巴、血行或直接蔓延，从肾的一个部分扩散到其他部分或全肾。
肾结核的症状也会有全身结核的一些表现，表现就是乏力、盗汗、纳差。乏力就是觉得身上没有力气，盗汗就是身上睡着觉以后会不自主地有出汗。低热，就是有温度不超过38.5℃的发烧，37.3℃以上，38.5℃以下。
肾结核经过半年至1年左右的抗结核内科药物治疗后，患侧肾脏因为结核而失去功能，由于患侧肾脏因为结核而钙化，包裹，形成结核性脓腔内有结核菌存在，抗结核药物无法到达，因此必须手术切除失去功能的肾脏。
肾结核都会转移，肾结核主要就是结核分枝杆菌通过血行由其它部位的感染而至，常见的就是肺结核传染。肾结核发展到一定的程度，会有大量的结核杆菌由肾脏排到输尿管，排到膀胱，甚至通过前列腺汗逆行感染，或者射精管逆行感染到前列腺、输精管、睾丸、附睾等，会导致前列腺结核、睾丸附睾结核、输精管结核等。
