对于子宫内膜不典型增生的治疗，首先要明确诊断，查清原因，若伴有多囊卵巢、卵巢功能性肿瘤、其他内分泌功能紊乱，应行针对性治疗。同时对诊断为子宫内膜不典型增生者即刻开始对症治疗，采用药物治疗或手术治疗。方案的选择对生育的要求，年龄小于40岁者，其癌变倾向低，可首先考虑药物治疗。
果患者有生育要求，年纪比较轻，这类患者应药物保守治疗。一使用大剂量高效的合成孕激素治疗。患者没有生育要求，且年纪比较大，可以考虑手术治疗。手术治疗一般选择子宫切除术，术后需禁止性生活及盆浴，且注意休息。
非典型子宫内膜增生是比较严重的，如果没有及时的治疗很可能会导致月经紊乱或者不规律出血的情况，也可能会诱发贫血的，这段时间还是多休息，观察经期的变化，注意积极加强营养调经。
非典型增生不是癌，分为轻度、中度和重度，非典型增生可发生在鳞状上皮和腺上皮。非典型增生是介于正常细胞和癌的中间站，是从量变到质变的过程，所以说它是癌前病变。
子宫内膜复杂性非典型性增生，就是疾病的一种交界性病变，对于复杂性非典型性增生的，有可能是多囊卵巢或者是卵巢肿瘤而造成的，卵巢肿瘤也分为良性的或者恶性的还有交界性的疾病而造成的。子宫内膜复杂性非典型性增生，也可见于交界性肿瘤，还可见子宫内膜癌早期的病变。所以，子宫内膜复杂性非典型性增生，包括好几种意思，可能是交界性的肿瘤性病变，也可能是子宫内膜癌的早期病变开始。
子宫内膜的非典型增生是子宫内膜病理活检的结果，如果病人比较年轻，还有生育要求，可以采取保守治疗的方法，就是应用大剂量的孕激素，连续应用3个月或者放置乐环，3个月后再次做子宫内膜癌的病理活检。如果症状没有改善，也可以再继续应用3个月，6个月以后如果没有好转或者病情加重，就需要做子宫全切的手术，避免进一步发展形成宫颈癌。
