问题分析：您好，根据您的情况描述，月经来了一天，过两天又来了一点就不来了。
指导建议：鉴于您的年龄，今年16岁在青春期，只要月经能来能走，不是持续不停，可以暂时观察。
患者经期只有一点点褐色的，接着就没有了，考虑是怀孕了。因为部分患者受精卵在子宫内膜着床的时候可能会刺激子宫从而引起收缩，如果受精卵离着床部位比较远的地方，可能会少许的子宫内膜脱落。此外，受精卵着床的时候，子宫内膜可能会产生排斥反应，从而导致出血，一般要出血量不是很多，患者也没有腹痛症状，胎儿都能够顺利的成长发育。
大姨妈来两天就没有了是不的正常：
正常的月经持续时间就是3到7天，也是相对固定的标准，在这个期间内，都属于正常的月经。当然，还需要综合月经是否存在其他的异常，比如月经量是否很大，是否有痛经，月经期间是否有肉样血块流出等。如果这些异常都没有，就不用担心。一两天就干净了，说明月经是不正常的，一般还会伴随有月经量少的特点。
要看操作者是否熟练了，一般熟练的人几分钟就搞定了。平时应该多注意这方面的安全保护，防止意外的怀孕了。平时可以多测量基础体温，了解生理周期了。药流的特点，虽然机械伤害微小，但是大剂量的激素，相对造成的内分泌失调又重些了，但是可以通过排除孕囊后，服用一些药物而达到止血的目的，以及恢复正常月经了。
月经40天了还没有这排除怀孕后考虑为内分泌紊乱所引起的月经不调。建议可以去医院做一下激素六项水平检测，查明原因后根据检查结果在医生的指导下进行针对性治疗，平时注意休息，避免劳累，加强营养，避免生冷辛辣刺激性的食物。
大姨妈三天没有来了，说明大姨妈可能已经超期三天了，这应该不用担心，因为月经并不是那么绝对的规律，提前或者延后一星期都属于正常。如果有性生活，没有采取避孕措施，月经超期三天，需要警惕是否怀孕，可以买一条早孕试纸，可以使用晨尿检查一下。如果做检查没有怀孕，考虑是月经超期，如果月经超期十天还不来，可以看看医生，考虑吃点调经的药物。
