卵巢巧克力囊肿的典型的主要症状是以痛经为主，就是每次来月经的时候都有疼痛，而且痛经的症状表现为越来越剧烈，而且随着时间的推移，痛经的症状越来越严重。有些病人会表现为月经过多或月经不规则等表现，妇科检查可以发现卵巢增大，并且多与盆腔或子宫粘连成片，临床上需要与盆腔炎相鉴别，通过B超检查可以看到比较典型的卵巢囊肿的征象。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血，白带增多、色黄或是有异味有的时候也会出现白带夹有血丝的症状。有巧克力囊肿的女性80%有痛经。
巧克力囊肿的治疗有两种方式，一种是药物控制，效果不好。另一种是手术治疗，能够达到治疗的目的，但是需要选择合适的方式治疗，有些女性需要生育所以只能采取保守治疗方法。
有巧克力囊肿并不意味着无法怀孕。巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位症囊肿，是引起痛经以及不孕不育的常见因素。如果是比较小的巧克力囊肿，临床症状不典型时可以先尝试怀孕，是有几率成功怀孕的。但是如果巧克力囊肿比较大，或者引起明显的痛经症状时，建议应该先进行手术治疗，同时在术后使用药物才能够提高术后的受孕概率。
巧克力囊肿的复发率也是很高的，甚至更高。这主要是因为巧克力囊肿会造成囊肿壁与子宫组织发横粘连，手术很难将囊肿完整切除，在切除过程中多数会造成囊肿破裂，引起复发。吃药期间可以抑制囊肿不增长，但是巧克力囊肿的囊液根本不会因为吃药而消失。囊肿长大到一定程度由于囊内张力增高会导致自行破裂，可能由原来的一个囊肿发展成为两个甚至多个，由只是单侧囊肿发展变成双侧都有，所以要及早选择合理方法。
结膜性胸膜炎一般不会引起脑积水。这种症状主要会引起胸腔积液，可以通过拍片检查发现胸腔内有积液存在。如果胸腔内积液较多，就需要通过穿刺抽液进行处理，另外也要按照医生的嘱咐，服用抗结核药物进行治疗，如果患者伴有结核性脑膜炎，可能会引起脑积水，当出现结核性胸膜炎的时候需要及时的治疗，得到积极的控制后，就会让脑积水的概率降低。
