指甲真菌感染大多不能自愈，患者应积极治疗。
皮肤癣菌侵犯甲板及甲下所引起甲病变，俗称“灰指甲”。甲癣的病程缓慢，如果不进行治疗，可终身不愈，所以患者大多不能自愈。建议患者在医生的指导下使用阿莫罗芬、环吡酮胺、特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等抗真菌药物进行治疗，能够有效改善病情。
指甲真菌感染可内服药物，单纯服用抗真菌药物，如灰黄霉素、氟康唑、斯皮仁诺等药物均有一定疗效，并且方便，但因为这类药物必须达到真菌所寄生的甲板处，才能发挥抗菌作用。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
如果手上有真菌感染的时候，减轻真菌感染的症状，只是用醋浸泡是不会有很好的作用的，按疗程用药治疗，才能取得良好的效果。应该是局部用药，配合口服用药才好，积极治疗。
手指指甲的霉菌感染，目前主要的治疗方式是局部治疗。效果比较明显的是阿莫罗芬搽剂，涂抹前要先将病灶的指甲刮得很薄，涂抹时要注意对周围的肌肤进行保护。如果外用药物没有明显的作用，可以服用特比萘芬，伊曲康唑，氟康唑等抗真菌药物。指甲上的霉菌是一种很难治愈的疾病，需要长期的治疗。另外也要注意自己的身体和公众的健康，尽量不要去碰指甲。
梅毒一般不属于真菌感染的范畴。
梅毒是苍白螺旋体所致的一种慢性系统性传播疾病，梅毒病原体为梅毒螺旋体，总体上属细菌范畴，不是真菌感染所致传染病。梅毒可侵害脏器，可表现为淋巴结肿大，皮肤溃烂及腹痛腹泻等。多由性接触，母婴传播及血液传播而引起。可以在医生指导下使用抗生素进行针对性治疗。
一般情况下，脸部真菌感染的治疗方法有以下几方面：
患者可以先口服伊曲康唑胶囊，但需遵医嘱，用药前辅查肝功、血脂等，也可口服盐酸莫西沙星片、复方甘草酸苷片等，再用复方黄柏洗剂、晟露洗剂等冷湿敷贴，也可以用盐酸布替萘芬搽剂、盐酸特比萘芬乳膏等交替早、晚外涂。如感染较重，需预先进行皮肤无菌清创，再用碘化钾溶液、硝酸咪康唑软膏等交替早外涂，平时应忌辛辣、忌饮酒等。
