巧克力囊肿与中医的气滞血瘀有关，与宫寒，或是湿热的炎症引起的血瘀有关，需要中医把脉或四诊辨证检查诊断，进行治疗，主要是以活血化瘀，把巧克力囊肿消散掉，或是使月经调顺，月经正常，经来不痛。
巧克力囊肿应该在中医指导下服用中药治疗。在用药以后需要去医院做B超复查，如果再恢复正常，不需要进一步治疗。如果用药效果不理想，也可以去医院做腹腔镜的微创手术治疗。
一般是从整体的观念入手进行治疗，活血化瘀，软坚散结，疏肝理气，扶正固本，清热解毒等全面的调节女性内分泌，在治疗一段时间后气行血活，脏腑通顺。中医治疗巧克力囊肿最明显的优势就是不开刀，副作用比较小且在治疗后复发率是比较低的。
中医治疗卵巢巧克力囊肿以疏肝理气，扶正因本，活血化瘀，软坚散结，清热解毒为治疗思路。由于气血是肌体的物质基础，而脏腑为气血生化之源，分管气血的生成、统摄和运行。但中医治疗卵巢巧克力囊肿，并不是所有人都适用，具体还需要根据实际病情来看，因此女性朋友患有卵巢巧克力囊肿，一定不要盲目接受巧克力囊肿的治疗，需要去正规的医院听取专业医师嘱咐在考虑。
中医巧克力囊肿应该坚持吃中药成药或草药治疗，即可消除囊肿，又可以调理月经，中医认为气血失调有很大的关系。一般通过调理气血来达到消瘤化疗的作用，让人体吸收或者是在外拍消除病变。中医治疗卵巢巧克力囊肿是遵循治病求本的原则，以疏肝理气，扶正因本，活血化瘀，软坚散结，清热解毒为治疗思路。
中医上没有明确记载巧克力囊肿，但是中医认为巧克力囊肿的形成多和病人的生活习惯，或自身脏腑功能失调有很大关系，根据中医辨证治疗的法则，以活血化瘀，软坚散结，疏通经络等为立足点，重点辨证虚实，寒热，畅阻，从内调节脏腑功能，可以标本兼治，治好巧囊，治疗后复发率低。
