多囊卵巢囊肿可以手术治疗，如果囊肿比较小而且是良性的，一般不需要治疗也可以的，如果囊肿较大就可以手术，同时也要注意术后的保养，保持外阴清洁预防感染，少吃辛辣刺激性食物。
多囊和囊肿的机理不同，所以严重程度也会根据个体差异而定的，一般多囊卵巢主要影响卵子的成熟，可能会引发不孕，而卵巢囊肿如果长的位置影响到卵巢的功能，影响到体内激素水平，也会导致不孕的。
多囊卵巢综合征，首先就应该调整生活方式，应该控制饮食，增加运动，减轻体重。其次就是药物治疗了，可以周期性的口服短效避孕药，减少雄激素的产生，抑制子宫内膜的过度增生，抑制毛发生长，治疗痤疮，调节月经周期；对于有生育要求的女性，可以使用氯米芬等药物来诱发排卵。最后就是手术治疗。建议及时就诊，在医师指导下，选择治疗方案。
多囊和囊肿两个是不同的病症，是无法区比较严重性的。多囊卵巢通常是由于内分泌紊乱造成的卵泡发育不成熟，或者一次排出多个卵泡，子宫囊肿是一种良性改变，通过手术治疗是可以治好的。
多囊卵巢囊肿可以是生理性的（即是正常的随生理周期的变化可以自然消失的）或病理性的（由于疾病而形成的囊肿），生理性的囊肿无需手术，而病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理。
抗炎表浅的脓肿可选择口服抗生素，外用药涂，中药内服。手术治疗，抽脓减压局部消毒，暂时减轻脓腔张力，缓解疼痛，适用于临时应急处理，切开排脓在局部麻醉，排出脓液，迅速减轻症状，为了进一步减少手术创伤，可采取双向等压引流手术治疗，术中采取半切割挂线，并放置引流管，可不切断肛直环而使脓腔愈合。
