主要的区别就是肛周脓肿，需要进行治疗好的手术，也就是需要处理原发感染灶。肛周脓肿和皮下脓肿都是有感染形成，并且创面下面都有脓液的情况，但是肛周脓肿主要还是由于肛窦感染引起来的，也就是说肛周脓肿的原发感染灶在肛门里面。
肛周脓肿确实是肛门周围的炎症变化，根据中医治疗需要解毒。然而，由于肛周囊肿的特殊性，单纯解毒不能解决根本问题，其最重要的治疗方法是手术治疗。因为肛周脓肿是连接肛管和肛门外部的感染病灶，而不是简单的皮肤疖。因此，治疗原则是去除肛管内外连接的所有感染病灶。临时治疗是切开并引流肛周脓肿。
肛管直肠周围脓肿简称肛周脓肿，在中医上称为肛痈，是由于肛管直肠周围发生急性化脓性感染引起的疾病，主要发生的部位为肛门、肛管、直肠周围，发病率高，是肛肠科常见的三大疾病之一，发病率于性别有着极大的关系，男性多于女性，20-40岁男性成为了主要病发群体，如果不及时治疗很容易发展成为肛瘘。
需要应用抗生素治疗来促进炎症消退，另外可以进行细菌培养和药敏试验检查，检查结果选择敏感的抗生素，如果出现进一步加重，需要进行手术处理，切除脓肿，导致出现脑炎或脑膜炎，可以进行腰大池引流治疗。
肛周脓肿在肛门周围都可能会出现，肛周脓肿是一种常见肛肠科疾病，与局部卫生状况不好造成的感染有关，也可能有的原来有瘘管造成的，要进行手术治疗，切除或者切开局部积脓组织，同时进行局部换药及使用消炎药类，这样才能恢复。
