小儿单纯性肥胖的鉴别诊断主要是对伴有肥胖的遗传性疾病和内分泌疾病进行鉴别，遗传性疾病包括三种:
第一，Prader-Willi综合征，手脚小、身材矮小、体态肥胖、肌张力低、智力低下、外生殖器发育不良。
第二，Laurence-Moon-Biedl综合征，肥胖、多指、多趾、轻度智力低下、视网膜色素沉着、性功能降低。
第三，Alstmm综合征，失明、糖尿病、中央型肥胖、视网膜色素变性、神经性耳聋。
内分泌疾病包括肥胖生殖无能症，是由于下丘脑及垂体病变，体脂分布于磕下、颈、下肢、乳房、会阴、臀部。身材矮小，手指和脚趾纤细，第二性征延迟或没有。其他内分泌疾病有甲状腺功能降低、肾上腺皮质增生、生长激素缺乏等，都有皮质增多但均各有特点。
一般的流感主要有发热、流鼻涕、咽喉肿痛、咳嗽、全身酸痛等。这些患者的临床表现都比较轻微，经过正确的处理后，病情会有所好转。脑膜炎是由双球菌导致的，也有可能是由病毒感染导致的。病毒性脑炎的初期表现类似于流感，但其临床表现比较剧烈，不能很好的抑制住身体的温度，如果是感染了脑神经会引起剧烈的头痛、喷射性呕吐、嗜睡、神经反应阳性，还有可能会导致昏迷等。脑炎、流感、高热、恶心呕吐、食欲不振、浑身无力、头痛等都属于典型的表现。少数的人会有皮疹，不过这种情况比较轻微，一般不会表现出来。
通常情况下，功能性腹痛以腹部疼痛为主，但在检查时，其症状与患者的反应有所不同，在注意力不集中时，可显著缓解。具体分析如下：
右侧下腹部有明显的压迫感，同时还会出现反跳痛、肌肉紧张等症状。而在泌尿系统的病变中，往往会出现肾脏部位的敲击感，并伴有轻微的疼痛。这种情况可以做血常规、腹部彩超、腹部CT等检查来明确情况。
颈椎病和落枕通常有以下鉴别方法：
首先是压痛点和肌肉痉挛来进行分别，一般来说，颈型颈椎病多见于病变之间隙压痛及椎旁压痛阳性，而落枕多见于胸锁乳突肌和肩胛提肌压痛。同时患有颈椎病进行牵引后症状可缓解，而出现落枕在牵引后症状可加重。同时症状也有所不同，比如落枕只是局部，颈椎病可能引起全身症状，头疼、头晕、手麻、脚软。
脑炎的患者的诊断一般来说是需要结合患者的病史、相应的体格检查和辅助检查才可以确诊。
发热、头痛、癫痫发作、肢体的活动障碍、肢体的某些癫痫，尤其是局灶性的癫痫发作、反应迟钝、认知行为异常、共济失调等症状的患者，在发病前可能有感冒、受凉的病史，通过辅助检查可以发现病灶，腰椎穿刺脑脊液检查也能发现相应的抗体阳性和生化异常。脑炎的诊断要结合自身免疫性疾病、局灶性癫痫发作、自身免疫性疾病引起的中枢神经系统的病变、血管性疾病、肢体活动障碍等疾病的鉴别诊断。
肺栓塞属于肺血管性疾病，肺炎属于肺部感染。有些肺炎会表现为呼吸困难、胸闷、胸痛、咳嗽、咯血、发热，甚至胸片检查也会发现浸润灶。咳嗽咳痰主要是脓性痰，同时伴有不同程度的发烧。胸部X线表现为炎症性病变，血常规白细胞增多，痰培养可出现阳性反应，经抗感染处理后可缓解或消除，胸片炎性病变可逐步改善。肺栓塞的高危因素是肺栓塞，主要表现为胸闷、呼吸困难、胸痛、咯血等全身症状。
