大三阳主要的治疗还要根据乙肝病毒量。目前还没有可以抗衡乙肝的药物可以使用。目前多用的就是抗病毒的，或者是提高机体免疫力的，进行治疗，主要还要注意肝功能的保护。小三阳是否能够好清楚取决于其病因。
乙肝的病情是否严重主要是根据乙肝病毒的定量检测以及肝功能检查和b超检查，因为乙肝大三阳小三阳病人体内都是存在乙肝病毒的，而乙肝病毒的复制和传染，会对乙肝病人的肝脏细胞造成一定程度上的损伤，最终导致肝脏受损。重点并不是大三阳和小三阳哪个更好治，主要看病人体内病毒量以及肝功能的状态，要依大三阳和小三阳病情程度进行正规治疗。
乙肝大三阳和乙肝小三阳，是乙肝五项常见的结果之一。乙肝大三阳的临床意义，是乙肝病毒在体内大量复制，病毒载量高，传染性强。乙肝小三阳的临床意义，是乙肝病毒在体内复制量不断减少或者不复制，乙肝病毒载量相对较低，传染性更弱。乙肝大、小三阳自然转换，取决于机体的免疫系统。当机体的免疫系统发生变化，抑制乙肝病毒复制，就可以由大三阳转为小三阳。
大三阳转为小三阳，有可能是好的征象，也有可能是病情恶化的表现，还需要按照具体原因，转氨酶以及乙肝病毒来判断，若是病人感染乙肝病毒以后产生抵抗力将病毒清除，或者经过抗病毒治疗以后，产生抗体的同时，乙肝病毒转阴，这是好的现象，若是由于乙肝病毒前发生变异，抗原无法表达，只是显示抗体阳性，而乙肝病毒仍是持续高表达，转氨酶明显升高，这种症状下比普通的大三阳危害还要大，更容易出现肝硬化和肝癌。
首先是因为乙肝小三阳病毒可能悄悄变异，变成目前无法认识和检测到的形态，使乙肝小三阳患肝在不知不觉中纤维化和硬化或者癌变。而此时，在常规检测手段的监测下，可能乙肝小三阳肝功能正常、病毒DNA数据变化也不明显。显然比乙肝大三阳的危害性更具有隐蔽性，更容易癌变。
无论“大三阳”抑或是“小三阳”只是反映人体内携带病毒的状况均不能反映肝脏功能的正常与否因而不能用来判断病情的轻重.要想了解肝功能的情况是定期（3个月至6个月）到医院作一次肝功能和乙肝两对半检查。
