肾结核经过半年至1年左右的抗结核内科药物治疗后，患侧肾脏因为结核而失去功能，由于患侧肾脏因为结核而钙化，包裹，形成结核性脓腔内有结核菌存在，抗结核药物无法到达，因此必须手术切除失去功能的肾脏。
肾结核都会转移，肾结核主要就是结核分枝杆菌通过血行由其它部位的感染而至，常见的就是肺结核传染。肾结核发展到一定的程度，会有大量的结核杆菌由肾脏排到输尿管，排到膀胱，甚至通过前列腺汗逆行感染，或者射精管逆行感染到前列腺、输精管、睾丸、附睾等，会导致前列腺结核、睾丸附睾结核、输精管结核等。
需要行肾脏彩超，CT及尿常规，尿液检查结核杆菌治疗，金标准还是行肾脏穿刺活检明确，肾结核是由于结核杆菌侵犯肾组织，出现的结核症状，可有低热，盗汗，肾脏疼痛，血尿，蛋白尿及水肿等症状。
肾结核可以治好，肾结核的临床表现与病变侵犯的部位及组织损害的程度有所不同，病变初期局限于肾脏的某一部分则临床症状甚少，仅在检验尿液时有异常发现，肾结核不仅会造成泌尿系统功能障碍，严重者还会出现肾衰竭。
肾结核是全身结核病的一部分，治疗时应注意全身治疗。根据病人选择药物治疗和手术治疗两种方式。药物治疗的原则多采用早期、适量、联合、规律、全程的办法，药物治疗适用于早期的肾结核病人。比如尿中有结核杆菌，而影像学中没有肾盂、肾盏的变化，或者可以看见1-2个肾盏呈不规则的、虫蚀样的表现，这时正确使用抗结核药物的治疗是可以恢复的。
