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CA199是一项肿瘤标志物。在胰腺癌患者中，它的阳性率可以达到90%，在胆囊癌和胆管癌患者中阳性率可以达到85%。而在胃癌、结直肠癌的患者中，阳性率可以达到40%左右。但是CA199对早期肿瘤的诊断价值不是很大，因为早期病人的敏感度仅仅有30%。
胆道系统炎症，胰腺炎症，糖尿病血糖控制差的或者病史较长的，胃部恶性肿瘤，结肠、直肠、盲肠、十二指肠恶性肿瘤，胆囊、胆管恶性肿瘤，胰腺恶性肿瘤，肛管恶性肿瘤等都会导致ca199偏高。
不能将CA19-9来作为胃癌的诊断或筛检的指标，无论它的值偏高多少。CA19-9用来预测胃癌的敏感性较低，糖链蛋白19-9血中浓度升高的病患中，胰脏癌以及胆道癌发生机率较高。除了胰脏癌及胆道癌之外，还可以在结肠癌、直肠癌、肺癌等癌症患者查到CA19-9指标升高。
肝癌是高甲胎蛋白的常见原因之一。孕妇和新生儿甲胎蛋白，慢性肝炎，重症肝炎恢复，肝硬化，先天性胆管闭塞，畸形胎儿也有暂时性增加甲胎蛋白可能升高，但幅度小，时间短，生殖细胞肿瘤是相关的。甲胎蛋白是肿瘤标志物。通常由卵黄囊和胚胎肝脏产生，出生一年后维持在低水平，肝病增加，肝细胞癌和畸胎瘤明显增加，已被用作原发性肝癌临床诊断的常规指标之一。
甲胎蛋白偏高癌胚抗原正常不是癌症。甲胎蛋白主要用于肝脏肿瘤的筛查，尤其是原发性肝癌的特异性肿瘤指标。发现脑部恶性肿瘤或骨恶性肿瘤有肿瘤的时候，有肝脏占位，要检查癌胚抗原检查。
糖类抗原CA199是胰腺癌和胆囊胆管癌的标志物。对于胰腺癌或胆管癌或结肠癌在治疗过程中如果出现CA199在原来的基础上有了明显的增高，须详细检查是否出现了肿瘤复发或转移。另一方面胰腺炎、阻塞性黄疸、肝炎、肝硬化、支气管扩张等也会出现CA199的偏高。因此未得过肿瘤，如果出现CA199偏高，也应该做相关的检查排除相关的良、恶性疾病。
