肝癌是高甲胎蛋白的常见原因之一。孕妇和新生儿甲胎蛋白，慢性肝炎，重症肝炎恢复，肝硬化，先天性胆管闭塞，畸形胎儿也有暂时性增加甲胎蛋白可能升高，但幅度小，时间短，生殖细胞肿瘤是相关的。甲胎蛋白是肿瘤标志物。通常由卵黄囊和胚胎肝脏产生，出生一年后维持在低水平，肝病增加，肝细胞癌和畸胎瘤明显增加，已被用作原发性肝癌临床诊断的常规指标之一。
一般来说，怀孕后单纯的甲胎蛋白偏高属于正常现象，因为怀孕以后胎儿能够合成甲胎蛋白，进入孕妇体内，会导致测量的甲胎蛋白数值偏高，一般不超过400ug/L。一般分娩以后就会慢慢的恢复正常。
需要注意的是如果孕妇甲胎蛋白数值过高，有可能是异常情况，如甲胎蛋白升高可能与胎儿开放性的神经管畸形相关。其他如孕妇肝脏异常，甲胎蛋白也会病理性增高。建议患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
有一些良性的病变可以出现甲胎蛋白的升高，可能身体里会出现肿瘤。甲胎蛋白在成年人中主要适用于肝癌的筛查或者是肝癌的辅助诊断，甲胎蛋白偏高大部分是发生在肝癌的病人。
一般来说，如果孕妇患有急慢性肝炎，或者肝硬化，甚至胎儿神经管缺陷，或者胎儿脊柱裂等缺陷，都会造成孕妇甲胎蛋白偏高。建议及时治疗。
甲胎蛋白是新生的幼稚肝细胞分泌的，而胎儿肝细胞还没有发育完全，所以会分泌大量的甲胎蛋白。如果女性在怀孕期间甲胎蛋白水平较高，但不超过400ug/L，通常被认为是正常的生理表现。
甲胎蛋白妊娠后高是一种正常的生理现象，如果是因为胚胎的肝脏还没有完全的话，那么孕妇的甲胎蛋白含量应该不会高于400ug/l。还有一部分原因是因为病理原因。
孕妈妈自身有肝硬化、畸胎瘤等疾病；子宫内的畸形也会导致脊椎裂伤，如胎儿畸形。
妊娠中期是排除胎儿异常的重要阶段，注意营养均衡，怀孕期是胎儿长脂肪的时候，需要更多的蛋白质。
这种蛋白主要来自胚胎的肝细胞，胎儿出生后约两周甲胎蛋白从血液中消失，因此正常人血清中甲胎蛋白的含量尚不到20微克/升。所以，如果只有甲胎蛋白偏低，而无其他症状，这是正常的，不必担心。
