肾囊肿如果体积较小可以不必特殊治疗，定期随访观察即可，体积较大对肾功能造成影响需进行手术治疗。如果不及时治疗，囊肿可能会随着时间的推移而长大，并且生长的囊肿会压迫肾脏并导致肾脏损伤。
肾囊肿要多吃五谷杂粮、新鲜蔬菜和水果、牛、羊、猪的瘦肉、禽蛋类、牛奶、鱼虾等均可食用。注意多补充高纤维、高维素食物，不偏食，要忌饮酒，少吃辛辣、油炸食品；忌过甜食；忌盲目进补。
肾囊肿需要治疗。肾脏囊肿属于肾脏的良性病变，根据囊肿的大小，治疗方法不同，如果囊肿直径小于3.5cm，没有明显疼痛感。可以不需要做特殊处理。每半年左右，复查肾脏彩超了解囊肿大小变化即可。如果肾囊肿直径大于3.5cm，会压迫肾脏，引起疼痛、肾功能下降，就需要手术治疗。目前比较常用的方法是后腹腔镜下肾囊肿去顶加压术，手术目的是解除囊肿对肾脏的压迫，保护肾脏功能。
肾囊肿可以用艾灸，艾灸具有温经通络的作用，可以促进局部无菌性炎症的吸收，从而改善局部的炎性症状，达到治疗滑膜炎的效果。但是对于滑膜炎患者不能拘泥于艾灸作为唯一治疗方法。
一般不用治疗。患者每年定期到正规医院做彩超，监测囊肿发展，一般对肾脏功能不会产生多大的影响。但是如果当囊肿长得足够大的时候，就可能会对正常的肾组织产生挤压作用甚至影响到肾功能。通常可以考虑做穿刺抽液把囊肿里面的液体抽掉，然后注射无水酒精硬化囊肿，达到缩小囊肿的目的。
