乙肝合并肝功能异常治疗可以进行保肝治疗和抗病毒治疗。肝功能异常的保肝方法有口服保肝药物疗法和静脉滴注保肝药物疗法。肝功能轻度发生异常时，可以应用口服的保肝药物，肝功能中度或者重度异常时，需要静脉滴注保肝药物。
需要及时治疗，如果吃西药，一般是6个月一疗程，大多数人要吃2到3年，也有4，5年甚至更长时间的，吃西药的缺点是，只能暂时控制病情，无法根治，而且病毒容易变异，病毒变异后就需要改用别的要继续吃。
肝功能异常要及时用药控制，否则病情加重的还有可能导致肝硬化，肝腹水等疾病。平时要注意饮食清淡点，多喝水，多吃新鲜水果蔬菜，禁忌辛辣刺激的食物，忌烟酒，增强体质。定期复查肝功能。
也可能为乙肝异常，在肝炎病毒学检查中，甲肝、乙肝、丙肝、戊肝是属于不同的检查项目，不能互相替代。健康检查只检查甲肝、丙肝、戊肝只能看出是否受甲肝、丙肝、戊肝病毒感染，不能看得出是否感染乙肝病毒。如果疑似受乙肝病毒感染，需要做乙肝五项检查或者乙肝病毒DNA检查看一下情况。
乙肝小三阳肝功能异常的治疗尚没有特异性，主要的治疗是抗病毒治疗，恢复肝功、抗病毒、阻止肝纤维化三结合。没有一种药物可以直接杀灭乙肝病毒，而自身的免疫系统可以清除乙肝病毒。应恢复肝功能，免除肝功能持续损害，避免肝硬化的发生。
乙肝孕妇大三阳，目前肝功能异常，现在已经怀孕的话，必须做乙肝病毒DNA定量检查化验的，看一下病的病毒载量的数值，如果目前产检孩子一切正常的话可以要，但是在怀孕后期一定要做阻断治疗注射乙肝免疫球蛋白，孩子出生选择剖腹产，然后注射免疫球蛋白，阻断和接种乙肝疫苗。建议首先应该做全面的产检，若没有任何问题是可以要的。
