阴茎短小是一种较普通的先天性异常，阴茎长度比同龄人小2个标准差（cm）。此病与体内睾丸酮缺乏有关，睾丸酮缺乏是激素靶器官发育不良的结果。常伴有睾丸发育差，下降不全。另外一些器官发育（包括阴囊）也可受累。下丘脑分泌的黄体生成素释放激素（LHRH）减少。阴茎短小者影响正常夫妻生活，丧失正常生育能力。
及时去医院进行检查看看，只要有正常的射精，精子发育正常，这是不会影响生育的，定期体检，看看身体发育情况，如果过于短小，这可以去医院手术矫正等，平时加强饮食营养，加强锻炼身体。
阴茎短小还会造成其它器官的发育，常伴有睾丸发育差，造成包皮包茎。而包皮包茎有可能会引发前列腺炎，龟头炎等一系列男性疾病。青春期阴茎发育不良的在心理上有一定的自卑和压抑感，常年累积下来的心理压力会造成性格上的压抑，又发性自卑、性冷淡等严重的身心疾病。
阴茎短小指的是阴茎的长度小于正常平均值的2点5个标准差。对于成年男性来讲，阴茎在疲软状态下小于5厘米、在牵拉长度的条件下小于7厘米、在勃起的条件下小于9厘米，则称为阴茎短小。
一般情况下，尿道下裂伴有小阴茎，可以通过手术治疗的方式进行治疗。具体情况分析如下：
尿道下裂还会出现一些先天性的异常，比如阴茎下弯、阴茎短小等，如果尿道下裂的孩子不能站着，以后也会出现射精问题，这会对孩子造成一定的不良后果。如果是尿道下裂的诊断，需要立即进行尿道成型手术，以便使其能够恢复排尿功能和未来的生育能力，最好是尽早进行，1~2岁的儿童的生殖器官与5~6岁的孩子差不多，可以进行一次或两次手术。
