小三阳抗病毒治疗的停药标准是要求肝功能正常，表面抗原转阴、DNA转阴，达到这两个转阴之后再继续服药一年半以上，可以考虑停药。对于HBeAg阳性患者，出HBeAg血清学转换通常为大三阳转为小三阳并且HBVDNA检测不出，持续12个月以上，可以考虑停药;对于HBeAg阴性患者，如果HBsAg仍为阳性，何时停药尚不确定，在治疗至少持续2年以上，并且间隔6个月以上3次以上检查HBVDNA均为阴性。
乙肝小三阳患者做抗病毒治疗，需要根据肝功能检查、乙肝病毒DNA检查和B超检查结果来判定，假如乙肝小三阳患者的检查结果是乙肝病毒DNA定量大于10的3次方拷贝/毫升，其谷丙转氨酶水平大于80单位/升时，肝脏发生炎症坏死的程度大于2度等，就是抗病毒治疗的最佳时机。
乙肝小三阳抗病毒治疗主要目的是抑制病毒复制，减少传染性，改善肝功能，提高生活质量，减少或延缓肝硬化、肝衰竭、肝癌的发生，符合适应证者应尽量抗病毒治疗。其停药指征包括：肝功正常；病毒定量阴性；HBeAg出现血清学转换，出现HBeAb，这称为完全应答，抗病毒治疗病例中不超过30％。临床治疗时间目前倾向于长期用药，出现耐药后及时更换抗病毒药物。
乙肝小三阳如果治疗不及时或者控制不好病毒量，病毒量复制增多就会转成大三阳。乙肝小三阳转化成大三阳是病情复发、恶化的指征之一。所以要及时治疗，进行抗病毒治疗抑制病毒的复制，进行护肝治疗，以免肝脏的负担变大。平时不要经常熬夜、劳累过度，或嗜酒等不良习惯。
服用恩替卡韦抗病毒治疗已经3年，需要进行检查，检查提示肝功能正常、一直保持阴性，按照慢性乙肝防治指南的标准，可以考虑停药，停药以后，仍需定期3到6个月复查肝功能及HBVDNA，期间有不适随时就诊。
乙肝小三阳需要进行抗病毒治疗。定期到专科医院检查确定病情是否稳定，病毒复制状况、肝脏受损的程度，便于专科医生及时制定治疗方案。乙肝通过血液与体液传播，具有慢性携带状态。因其可能通过性生活传播，国际上将其列入性传播疾病。
