肺念珠菌病的治疗方法有以下几种：第一，积极配合医生治疗原发病，去除导致因素，例如需要停用抗生素糖皮质激素和免疫抑制剂。第二，加强病人的对症治疗，同时还要增强身体的免疫力，出现咳嗽、发热的时候要及时治疗。第三，通过抗真菌药物治疗，例如在医生的指导下应用卡泊芬净或者是酮唑，较为顽固的病人，可以在医生的指导下采用免疫治疗。
儿童念珠菌感染可侵犯消化道，呼吸道，泌尿道等器官，并可引起念珠菌感染和念珠菌血症。
儿童念珠菌病主要表现为粘膜病变，坏死组织，纤维素，大量的菌丝和芽孢，假膜脱落，出现灶性糜烂和出血性溃疡。内脏病变多为肉芽肿，急性播散性病变为灰色的细小脓肿，在病灶内有孢子和假菌丝。周围组织有嗜中性粒细胞和组织细胞，血管受到感染，会出现慢性血管炎变化，容易破裂出血，出现血栓，严重的免疫抑制患者炎症反应比较轻微，只有念珠菌和坏死组织的脓肿。
念珠菌病就是真菌感染引起的，通常是由念珠菌属主要是白色念珠菌引起的，男性发生念珠菌感染就需要通过进一步的检查才能够明确，基本上就是一个真菌性的炎症刺激引起的功能改变。
白念珠菌是一种卵圆形的芽生酵母。
在培养基、组织和分泌物中都会出现假菌丝，这种细菌是革兰氏阳性的，直径2~3μm*4~6微米，伸长的芽生细胞很像菌丝，所以被称为假菌丝。对于健康的携带者，唾液中的细菌含量在200/ml以下，所以常规的镜检方法无法检测到细菌，因为白色念珠菌对口腔粘膜的粘附力很强，是导致细菌感染的"立足点"，这种粘附力依赖于表皮细胞表面的甘露糖苷蛋白，从而起到粘附力的作用，从而可以有效地破坏糖类或类似结构的物质。
肺念珠菌病是由白念珠菌或其他念珠菌所引起急性、亚急性或慢性肺炎。肺假丝酵母菌病分为两种，也就是病程发展的两个阶段。
一、假丝酵母急性刺激性咳嗽，咳出的痰多为白色泡沫状，偶尔伴有血丝，随着病情的发展，粘稠的粘液会变得粘稠。胸闷，气短，尤其是在晚上。
二、念珠菌性肺炎其临床症状为沫粘痰、有酵臭味、或为胶冻，有时伴有咯血，与急性细菌性肺炎相似。
口腔念珠菌病的治疗是肯定要使用药物的，口腔念珠菌病主要是真菌在口腔内的感染，多发生于长期使用抗生素而抵抗力比较弱造成的口腔菌群的失调，导致真菌增生。可以用碳酸氢钠漱口，一般是在百分之3左右，通过药水交替的漱口抑制真菌的感染，从而治疗真菌感染。
