进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
如果同房导致妊娠，可以在7-10天后用早孕试纸进行检测，也可以到医院采血检测HCG和孕酮，可以初步诊断妊娠。现在怀疑自己怀孕了，可以去药店买一个怀孕测试棒或早孕试纸来测试，以确定怀孕，月经推迟约10天前去医院做B超检查，以确定是否怀孕。
通常刚受孕，如无不舒服的表现，也不需要过早地进行检查，可等妊娠50天后进行首次产检。
通过作B超可知道是宫内怀孕的情况，此外可根据有无胎心胎芽来判断是宫内活胎。如妊娠初期腹痛或阴道流血，应随时进行产检、抽血、化验激素、观察孕酮和hcg等指标，以排除是先兆流产或宫外孕的情况。同时可适当进行锻炼，增强自身免疫能力。
产后检查包括很多项目，需要做彩超，妇科检查，看看子宫，阴道，宫颈的恢复情况，如果做剖宫产的，还需要看看切口恢复情况，同时还需要做盆底检查。平时要勤洗外阴，勤换内裤，保持外阴清洁。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
