胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
如果直径大于5cm或者伴有明显的腰区胀痛、坠胀等，可以治疗。现在多采用经腹腔镜囊肿去顶术，手术创伤小，恢复快，效果好。也可以采用彩超引导下囊肿穿刺抽液，注入硬化剂治疗，但复发的机会比较大，现在常常用于不能耐受手术，年龄比较大，体弱者。肾囊肿药物治疗是无效的。如果肾囊肿伴有钙化，更应该及时到泌尿外科就诊。
艾灸是不能治疗肾囊肿的，药物也不能治疗肾囊肿，肾囊肿的发病的原因是扩张的肾小管，这段扩张的肾小管，逐步独立，就形成一个囊肿，肾小管的壁有分泌功能，分泌液多就会囊肿增大，分泌液少囊肿增大的不明显。
肾囊肿穿刺硬化治疗是治疗肾囊肿的一种比较好的方法，它就是在b超的引导下，经皮肾穿刺进入囊腔内，将囊腔内的液体抽出，然后按照一定的比例将95%的无水酒精或者其他的硬化剂注入囊壁内，通过充分的灌洗将肾囊肿的囊壁黏膜进行破坏，减少囊壁的分泌功能，通过这种治疗可以减轻囊肿的进度，可以使囊肿缩小，囊肿的分泌功能减退，从而抑制囊肿进一步的增大，达到治疗效果。
肾囊肿根据囊肿大小确定治疗方法，单纯性肾囊肿如果囊肿较小，是不需要任何治疗的，只需要定期的进行检查观察囊肿大小。若发现有血尿、尿频、持续性发热等典型的症状，要及时到医院检查和治疗。对于囊肿较大，出现的尿路梗阻、血管闭塞，可以用硬化疗法治疗。如果囊肿巨大，需要进行手术治疗。
