肾囊肿根据囊肿大小确定治疗方法，单纯性肾囊肿如果囊肿较小，是不需要任何治疗的，只需要定期的进行检查观察囊肿大小。若发现有血尿、尿频、持续性发热等典型的症状，要及时到医院检查和治疗。对于囊肿较大，出现的尿路梗阻、血管闭塞，可以用硬化疗法治疗。如果囊肿巨大，需要进行手术治疗。
如果患有肾脏中以后不要随意用药。因为目前还没有最可靠的药物来把肾囊肿消除。但是可以去中医那检查查查用一些药物控制肾囊肿的增长。民天中有一些小偏方可以尝试一下。第一种是用白茅根煮水以后服用，每日一次就可以。另一种方法是用车前子，泽泻每样煮水每天喝一次。但不能以片方为主，还是要随时观察以免肾囊肿长大以后影响肾功能。
肾囊肿可单发或者多发，常见于男性，可压迫血管或者引发尿路梗阻出现病症，可有腰腹背部间歇性钝痛，继发感染可出现尿频尿急等症，B超，ct检查可诊断，手术治疗是有效办法。就诊肾脏外科检查治疗，适当补充高纤维、高维素食物，多吃新鲜蔬果，忌饮酒，少吃辛辣、油炸食品。
肾囊肿比较小没有必要手术治疗，属于良性的，和遗传有一定的关系。注意定期复查即可，肾囊肿增大到一定程度可以导致腰痛和肾功能障碍。常用的手术方式可以采取经皮介入治疗，或者采用手术切除囊肿治疗。
胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
出现肾囊肿之后可以采取中药调理，中药调理可以帮助更好的治疗，但是不能够起到完全恢复的效果，因为出现是那种属于慢性疾病，这个阶段吃中药不能够帮助恢复，如果想要恢复，还应该到医院检查治疗，然后做手术进行改善。