自然流产没流干净首先要检查B超，根据胚胎组织残留的大小，判断吃药还是手术治疗，具体情况如下：
若直径小于20mm的胚胎组织，可以益母草、五加生化胶囊等活血化瘀的药物，帮助排出胚胎组织。服药1周左右，判断药物治疗效果要去医院复查B超。服药期间适当活动，帮助排出组织物。同时，不吃生冷、辛辣、刺激的食物，可以吃一些蔬菜、水果等。若B超显示组织物直径超过20mm，且数量较多，通常吃药治疗效果不大，建议进行清宫手术。
自然流产后一般流干净了，具体分析如下：
自然流产可以排出体外，但也有一些身体素质比较弱的女性，会出现不洁的情况。如果是自然流产，一般在自然流产一周后到医院做详细的检查，如果还没有完全排出，一定要在医生的指导下进行清宫，避免感染，影响身体健康。如果已经排出了，日常生活中要注意清洁卫生，做好避孕措施，多吃一些有营养的食物，不要食用辛辣刺激性的食物，同时要把内裤和毛巾暴露在阳光下，消毒。
自然流产清宫后一周到医院复查，查看宫腔内情况及子宫恢复情况。一个月以内不能过性生活，多注意休息，避免剧烈运动，不要碰冷水，不要吃生冷辛辣刺激性食物，做好保暖措施，避免着凉。
自然流产通常阴道出血的时间不超过一周，如果在自然流产后一周没有阴道出血的症状。流产后随着子宫内膜的修复，子宫的收缩，如果出血逐渐停止，那么应该就是流产干净了。
自然流产一般阴道出血的时间不超过一周，如果在自然流产后一周没有阴道出血的症状，说明流干净了。一般在自然流产后一周需要到医院做一个子宫附件B超或彩超检查，看看宫腔内是否有残留物的回声，如果宫腔内没有残留物的回声，说明是流干净了。
如果自然流产完全了，是不用继续清宫的。流产后去医院复查宫内是否还有残留即可，如果有残留就要清宫手术的。另外手术后需要卧床休息一周以上，保持良好的心态，不要过于伤心，不然都影响恢复的。定期去复查，半年后可以再次怀孕的。
